RibosePreferenceAnalysis：揭秘DNA中rNMP的独特偏好分析工具

RibosePreferenceAnalysis是一款专为分析嵌入在基因组DNA中的核糖核苷酸单磷酸(rNMP)偏好性的软件，由Penghao Xu和Francesca Storici在佐治亚理工学院生物科学学院开发。该软件旨在帮助研究人员识别rNTP掺入DNA的倾向以及研究这些嵌入rNMP的基因组背景，对于理解基因组稳定性及DNA生物学具有重要意义。 该软件的核心功能包括rNTP掺入的检测、嵌入rNMP的去除以及对rNMP功能的探讨。它基于Python3编写，依赖于Matplotlib、Seaborn和Scipy等库进行数据处理和可视化。V21版本的代码可以从GitHub的SIMPAC-2021-105 Reproducible Capsule获取，链接为<https://github.com/SoftwareImpacts/SIMPAC-2021-105ReproducibleCapsule/tree/v1>，并采用GPL-3.0开源许可证。此外，开发者还提供了开发文档和用户手册，可以通过GitHub的README.md找到，用户遇到问题可以联系作者。 软件的最新版本1.1提供了可执行文件，可通过<https://github.com/xph9876/RibosePreferenceAnalysis/releases/tag/v1.1>下载。这款软件适用于Linux和OSX系统，安装时需要确保已安装Python3、Matplotlib、Seaborn和Scipy等依赖库。为了方便用户，软件还提供了支持邮件渠道，以便解决安装和使用过程中可能遇到的问题。 RibosePreferenceAnalysis是基因组研究领域的一个实用工具，它通过分析rNTP掺入现象，为深入探究DNA的结构和功能变化提供了强大的数据分析手段。对于任何关注DNA生物学和基因组稳定性研究的科学家来说，掌握和使用这款软件将有助于推进相关领域的研究进展。