TFMLAB:一站式4D牵引力显微镜MATLAB工具箱
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更新于2025-01-16
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TFMLAB是一个专为4D(空间三维+时间)牵引力显微镜(TFM)设计的MATLAB工具箱,由Jorge Barrasa-Fanoa等人开发,旨在为技术经验有限的研究人员提供易用且功能强大的分析工具。该软件包的出现填补了现有开源程序中缺乏针对4D体外系统实时细胞力研究的空白。
TFMLAB的核心价值在于其集成的完整工作流程,包括图像处理(如共聚焦显微镜下的图像分析)、细胞分割、图像对齐、基质位移测量以及力的恢复。这些功能使得研究人员能够方便地在实验过程中实时监测细胞与周围环境的相互作用,对于理解细胞力学、生物材料性能以及组织工程等领域具有重要意义。
软件设计上,TFMLAB采用了交互式的图形用户界面(GUI),极大地提升了用户体验和工作效率。该软件基于MATLAB编写,支持DIPImage库和Elastix等其他工具,确保了兼容性和灵活性。同时,TFMLAB遵循Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives (CC BY-NC-ND) 4.0许可协议,允许在学术研究中非商业性使用,且不得修改作品。
TFMLAB的最新代码版本v1.0可以从GitHub获取,链接为<https://github.com/ElsevierSoftwareX/SOFTX-D-20-00104>,并受GNU Lesser General Public License v3.0 (LGPLv3.0)法律许可。开发过程采用GitLab的版本控制系统,并提供了开发者文档和手册,供用户参考和深入学习,支持邮箱地址可用于获取进一步的技术支持。
TFMLAB的开发源于对现有技术需求的洞察,旨在通过简化复杂的数据处理和分析步骤,推动科研人员在细胞力学研究领域取得更精确、实时的成果,从而推动科学前沿的发展。对于那些需要利用TFM技术进行研究但缺乏编程背景的科学家来说,TFMLAB无疑是一个极具价值的开源资源。
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