翻译:[V, D] = eig(data_cov);
时间: 2023-08-01 19:07:10 浏览: 159
这段代码是MATLAB语言中的特征值分解函数,它的功能是对一个协方差矩阵进行特征值分解,返回特征值和特征向量。
具体解释如下:
- eig:MATLAB中的特征值分解函数,可以对方阵进行特征值分解。
- data_cov:需要进行特征值分解的协方差矩阵。
- V:特征向量矩阵,每一列是一个特征向量。
- D:特征值矩阵,对角线上的元素是特征值。
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import numpy as np def pca(X, threshold): # 去均值 X_mean = np.mean(X, axis=0) X = X - X_mean # 计算协方差矩阵 cov = np.dot(X.T, X) / (X.shape[0] - 1) # 计算特征值和特征向量 eig_vals, eig_vecs = np.linalg.eig(cov) # 对特征值进行排序 eig_vals_sort = np.argsort(eig_vals)[::-1] # 计算累计贡献率 eig_vals_sum = np.sum(eig_vals) cumsum = np.cumsum(eig_vals[eig_vals_sort]) / eig_vals_sum # 寻找最佳的n_components best_n_components = np.argmax(cumsum >= threshold) + 1 # 提取前best_n_components个特征向量 eig_vecs_sort = eig_vecs[:, eig_vals_sort[:best_n_components]] # 将数据投影到新的特征空间上 X_pca = np.dot(X, eig_vecs_sort) return X_pca # 生成数据集 data = np.random.rand(643, 1024) # 进行PCA降维 X_pca = pca(data, threshold=0.9) # 输出结果print("最佳的n_components为:", X_pca.shape[1])中threshold=0.9是怎么算出来的
在这段代码中,threshold=0.9 是作为一个参数传入函数pca()中的,它代表着累计贡献率的阈值,用于确定保留多少个主成分。在该函数中,累计贡献率是通过计算特征值的和来计算的,然后通过计算每个特征值在特征值总和中的占比,来确定保留多少个主成分。因此,当阈值设为0.9时,函数会保留主成分的数量,使得它们对原始数据的解释方差和至少达到90%。
import numpy as np def pca(data, k): u = np.mean(data, axis=0) after_demean = data - u cov = np.cov(after_demean.T) value, vector = np.linalg.eig(cov) idx = np.argsort(value)[::-1] idx = idx[:k] P = vector[idx] return data.dot(P.T)
这是一个PCA(Principal Component Analysis)降维的Python代码。主要实现了以下功能:
1. 对给定数据进行去均值操作。
2. 计算数据的协方差矩阵。
3. 对协方差矩阵求特征值和特征向量。
4. 对特征值进行降序排序,选择前k个特征值对应的特征向量。
5. 构建投影矩阵P,将数据投影到新的k维空间中。
6. 返回降维后的数据。
该代码与上一个代码的区别在于计算协方差矩阵的方式和对特征值进行排序的方式。在该代码中,使用了更加高效的计算方法,即使用np.cov()计算协方差矩阵,并使用np.argsort()对特征值进行排序。
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