relieff算法python实现
时间: 2023-09-14 07:15:48 浏览: 189
以下是 ReliefF 算法的 Python 实现:
```python
import numpy as np
def relief(X, y, k):
n_features = X.shape[1]
weights = np.zeros(n_features)
for i in range(len(X)):
diff = np.abs(X - X[i])
nearest = np.argsort(np.sum(diff, axis=1))[1:k+1]
near_hit = X[nearest][y[nearest] == y[i]]
near_miss = X[nearest][y[nearest] != y[i]]
weights += np.sum((X[i] - near_hit)**2, axis=0) / k
weights -= np.sum((X[i] - near_miss)**2, axis=0) / k
return weights
```
其中,`X` 是训练数据的特征矩阵,`y` 是训练数据的标签,`k` 是算法中的参数,表示每个特征向量要考虑的最近邻个数。函数返回一个长度为 `n_features` 的向量,表示每个特征的重要性权重。
相关问题
reliefF算法详细介绍及实例python代码
reliefF算法是一种特征选择算法,它可以用于分类和回归问题。它的主要思想是通过比较样本之间的差异来评估每个特征的重要性,从而选择出最有用的特征。
算法实现
reliefF算法的核心思想是对每个特征进行评分,评分的方法是通过计算每个特征与相邻样本之间的差异来实现的。对于二分类问题,reliefF算法的计算过程如下:
1. 随机选择一个样本作为当前样本。
2. 计算当前样本与其他样本之间的距离,其中距离的计算方式有很多种,可以使用欧几里得距离、曼哈顿距离或者其他距离度量方式。
3. 找到与当前样本同类的最近邻和不同类的最近邻。
4. 对于每个特征,计算它在当前样本和它的同类最近邻之间的差异和它在当前样本和它的不同类最近邻之间的差异。
5. 根据差异的大小对每个特征进行权重排序,权重越大的特征越重要。
对于多分类问题,reliefF算法的计算过程类似,只是在第三步中需要找到与当前样本同类的最近邻和不同类的最近邻的数量会增加。
实例代码
下面是一个使用reliefF算法进行特征选择的python实现。假设我们有一个包含10个特征和一个二分类标签的数据集,我们将使用reliefF算法来选择最重要的特征。
```python
import numpy as np
from sklearn.datasets import make_classification
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier
# 生成一个包含10个特征和二分类标签的数据集
X, y = make_classification(n_samples=1000, n_features=10, n_informative=5, n_redundant=0, random_state=42)
# 将数据集分为训练集和测试集
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.3, random_state=42)
# 定义reliefF算法
def reliefF(X, y, k):
# 初始化每个特征的得分为0
scores = np.zeros(X.shape[1])
# 计算每个样本与其他样本之间的距离
distances = np.sum((X[:, np.newaxis, :] - X[np.newaxis, :, :]) ** 2, axis=-1)
# 对每个样本进行操作
for i in range(X.shape[0]):
# 找到与当前样本同类的最近邻和不同类的最近邻
same_class = np.where(y == y[i])[0]
diff_class = np.where(y != y[i])[0]
nearest_same = same_class[np.argsort(distances[i, same_class])[1:k+1]]
nearest_diff = diff_class[np.argsort(distances[i, diff_class])[0:k]]
# 对于每个特征,计算它在当前样本和它的同类最近邻之间的差异和它在当前样本和它的不同类最近邻之间的差异
for j in range(X.shape[1]):
diff_same = np.abs(X[i, j] - np.mean(X[nearest_same, j]))
diff_diff = np.abs(X[i, j] - np.mean(X[nearest_diff, j]))
scores[j] += diff_diff - diff_same
# 根据差异的大小对每个特征进行排序,返回排序后的特征和得分
return np.argsort(scores)[::-1], np.sort(scores)[::-1]
# 使用reliefF算法选择最重要的特征
k = 5
idx, scores = reliefF(X_train, y_train, k)
print("重要特征:", idx[:k])
print("特征得分:", scores[:k])
# 使用选择的最重要的特征训练k近邻分类器并测试
clf = KNeighborsClassifier()
clf.fit(X_train[:, idx[:k]], y_train)
acc = clf.score(X_test[:, idx[:k]], y_test)
print("测试准确率:", acc)
```
参考资料
1. Kira, K., & Rendell, L. A. (1992). The feature selection problem: Traditional methods and a new algorithm. AAAI-92 Proceedings.
2. Kononenko, I. (1994). Estimating attributes: analysis and extensions of relief. In European Conference on Machine Learning (pp. 171-182). Springer, Berlin, Heidelberg.
ReliefF算法代码
ReliefF算法是一种基于距离的特征选择方法,主要用于高维数据集中的变量重要性评估。它通过构建正负样本之间的差异向量来进行计算,旨在挑选出能够最大程度区分正负样例的特征。
以下是简单的 ReliefF 算法的伪代码描述:
```python
# 定义 ReliefF 函数
def reliefF(X, y, num_neighbors=5):
n_samples, n_features = X.shape
feature_importance = np.zeros(n_features)
for i in range(n_samples):
# 随机选取一个正样本作为参考点
if y[i] == +1:
pos_example = X[i]
else:
pos_example = None
# 计算所有样本到参考点的距离
distances = euclidean_distances(X, pos_example)
# 从正样本集中获取 k 近邻
neighbors = np.argsort(distances)[:num_neighbors]
# 如果有正样本,则更新正样本邻居的权重
if pos_example is not None:
weights = [y[j] for j in neighbors if y[j] == +1]
weight_diff = abs(np.mean(weights) - 1)
else:
weight_diff = 0
# 更新所有负样本的特征重要性
for neg_index in neighbors[y[i] == -1]:
feature_importance += weight_diff / (num_neighbors * np.linalg.norm(X[neg_index] - pos_example))
return feature_importance
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