请提供使用python实现基于传算法工具箱GEAPT进行遗传算法优化OneClassSVM分类器参数的示例代码,
时间: 2023-06-06 17:08:17 浏览: 139
SVM.zip_Python 分类 SVM_accordinglrk_python SVM 分类_svm python_svm
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非常感谢您的问题,以下是使用 Python 实现基于传算法工具箱 GEAPT 进行遗传算法优化 OneClassSVM 分类器参数的示例代码:
```
# 导入所需的库
from sklearn.svm import OneClassSVM
from sklearn.datasets import make_classification
from geatpy import GeneticAlgorithm, Individual
import numpy as np
# 定义适应度函数
def cal_fitness(individual):
# 将个体解码为参数值
gamma = individual.decoding(0, 1, 10**(-5), 10**3)
nu = individual.decoding(1, 0.01, 0.5)
# 使用参数训练 OneClassSVM 分类器,并计算分类精度
clf = OneClassSVM(nu=nu, kernel='rbf', gamma=gamma)
clf.fit(X_train)
y_pred = clf.predict(X_test)
score = sum(y_pred == y_test) / len(y_test)
# 将分类精度作为适应度值
return score,
# 生成样本数据
X, y = make_classification(n_samples=1000, n_features=10, n_informative=3,
n_redundant=0, n_clusters_per_class=2, random_state=1)
X_train, X_test = X[:800], X[800:]
y_train, y_test = y[:800], y[800:]
# 定义问题类
class MyProblem(GeneticAlgorithm):
# 定义种群规模和变量数
def __init__(self):
self.problemType = 'R' # 表示实数问题
self.populationSize = 20 # 种群规模为 20
self.varTypes = [0, 0] # 两个变量均为实数型变量
self.varRanges = [[-5, 3.3219], [0.01, 0.5]] # 变量范围分别为 [-5, 3.3219] 和 [0.01, 0.5]
# 适应度函数的输入变量必须是个体对象
def aimFunc(self, individual):
return cal_fitness(individual)
# 执行遗传算法优化
myProblem = MyProblem() # 初始化问题类
myProblem.MAXGEN = 50 # 最大遗传代数为 50
myProblem.verbose = True # 输出优化过程信息
myAlgorithm = myProblem.getTransferEA() # 获得传算法算法模板
bestIndividual, bestFitness = myAlgorithm.run() # 执行算法
# 输出最优解以及其对应的适应度值
print('最优解:', bestIndividual.var)
print('最优适应度值:', bestFitness)
```
代码中使用 `make_classification` 函数生成 1000 个样本数据,其中有 10 个特征,3 个与分类有关。我们将前 800 个样本作为训练集,后 200 个样本作为测试集。`MyProblem` 类是我们定义的遗传算法问题类,其中 `aimFunc` 函数中调用 `cal_fitness` 函数计算个体的适应度值,即 OneClassSVM 分类器在测试集上的分类精度。为了将适应度值最大化,我们需要将 `cal_fitness` 函数的返回值封装为只有一个元素的元组,并使用逗号将其与空元组分隔开。遗传算法优化过程中,我们通过调用 `myAlgorithm.run()` 函数执行算法,并获得最优解以及其对应的适应度值。
注意,本代码示例仅用于演示如何使用遗传算法优化 OneClassSVM 分类器的参数,具体应用中还需要根据实际数据情况进行调参,不同的数据集可能需要不同的参数设置。
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