Nomo <- nomogram(svm,fun=plogis, + lp=F,fun.at=c(0.1,seq(0.2,0.8,by=0.1),0.9), + funlable="Risk of SVM") Error in nomogram(svm, fun = plogis, lp = F, fun.at = c(0.1, seq(0.2, : factor name(s) not in the design: funlable
时间: 2023-12-07 17:02:53 浏览: 27
这个错误提示中的拼写错误,应该是`funlabel`而不是`funlable`。因此,您需要将`funlable`改为`funlabel`即可解决此错误,如下所示:
```
Nomo <- nomogram(svm, fun = plogis, lp = F, fun.at = c(0.1, seq(0.2, 0.8, by = 0.1), 0.9), funlabel = "Risk of SVM")
```
请注意,`funlabel`参数用于指定因变量的标签。它应该是一个字符串,表示模型预测的风险或概率。您可以根据您的模型和数据选择适当的标签。
相关问题
Nomo <- nomogram(svm, fun = function(x) + predict(svm, x, probability = TRUE)[, 2], funlabel = "Risk of SVM") Error in lims[[i]] : subscript out of bounds
在这段代码中,出现了一个错误,错误信息是“subscript out of bounds”。这个错误通常是由于尝试访问一个向量或列表的不存在的元素而导致的。
在这个具体的代码中,可能是因为lims参数设置出现了问题,导致了这个错误。lims参数用于指定诺莫图中每个变量的取值范围,在设置时需要注意格式和长度。
可以尝试修改代码,检查lims参数的设置是否正确,如下所示:
```R
# 创建一个SVM模型
data <- iris
data$Species <- ifelse(data$Species == "versicolor", "versicolor/virginica", data$Species)
svm <- svm(Species ~ ., data = data, probability = TRUE)
# 生成诺莫图
Nomo <- nomogram(svm, fun = function(x) predict(svm, x, probability = TRUE)[, 2], funlabel = "Risk of SVM", lp=TRUE, se.fit=FALSE, yscale=0.5)
# 设置lims参数
lims <- list(Age = c(0, 100),
Sex = c(0, 1),
Race = c(0, 1),
# ...其他变量的取值范围
DXlung = c(0, 1))
# 绘制诺莫图
plot(Nomo, cex.axis = 0.8, col.grid = "gray", col.lines = "darkgray", col.text = "black", lty.grid = 1, lims = lims)
```
在这个修改后的代码中,lims参数被设置为一个列表,其中每个元素是一个向量,表示对应变量的取值范围。需要确保lims参数的长度与诺莫图中的变量个数相匹配。同时,注意lp和se.fit参数的设置,根据实际需要进行调整。
Nomo <- nomogram(DXliver1~Age2+ Sex2 + Race2 + Site2 + Site3 + Grade2 + Grade3 + Grade4 + Stage2 + + Stage3 + Chemotherapy2 + Income2 + Income3 + Marital2 + Marital3 + Marital4 + DXbone2 + + DXlung2, lp = F, fun.at = c(0.1, seq(0.2, 0.8, by = 0.1), 0.9) + , data = test) Error in names(.res) <- .names : 'names' attribute [1] must be the same length as the vector [0]
在这段代码中,似乎是fun.at参数的设置中有问题,导致了这个错误。具体来说,可能是在fun.at参数设置时,使用了多余的加号“+”,导致了语法错误。
可以尝试修改代码,去掉多余的加号,如下所示:
```R
Nomo <- nomogram(DXliver1~Age2+ Sex2 + Race2 + Site2 + Site3 + Grade2 + Grade3 + Grade4 + Stage2 + Stage3 + Chemotherapy2 + Income2 + Income3 + Marital2 + Marital3 + Marital4 + DXbone2 + DXlung2, lp = F, fun.at = c(0.1, seq(0.2, 0.8, by = 0.1), 0.9), data = test)
```
在这个修改后的代码中,fun.at参数的设置不再包含多余的加号,应该可以正常运行。