Nomo <- nomogram(svm,fun=plogis, + lp=F,fun.at=c(0.1,seq(0.2,0.8,by=0.1),0.9), + funlable="Risk of SVM") Error in nomogram(svm, fun = plogis, lp = F, fun.at = c(0.1, seq(0.2, : factor name(s) not in the design: funlable
时间: 2023-12-07 18:02:53 浏览: 153
这个错误提示中的拼写错误,应该是`funlabel`而不是`funlable`。因此,您需要将`funlable`改为`funlabel`即可解决此错误,如下所示:
```
Nomo <- nomogram(svm, fun = plogis, lp = F, fun.at = c(0.1, seq(0.2, 0.8, by = 0.1), 0.9), funlabel = "Risk of SVM")
```
请注意,`funlabel`参数用于指定因变量的标签。它应该是一个字符串,表示模型预测的风险或概率。您可以根据您的模型和数据选择适当的标签。
相关问题
Nomo <- nomogram(svm, fun = function(x) + predict(svm, x, probability = TRUE)[, 2], funlabel = "Risk of SVM") Error in lims[[i]] : subscript out of bounds
在这段代码中,出现了一个错误,错误信息是“subscript out of bounds”。这个错误通常是由于尝试访问一个向量或列表的不存在的元素而导致的。
在这个具体的代码中,可能是因为lims参数设置出现了问题,导致了这个错误。lims参数用于指定诺莫图中每个变量的取值范围,在设置时需要注意格式和长度。
可以尝试修改代码,检查lims参数的设置是否正确,如下所示:
```R
# 创建一个SVM模型
data <- iris
data$Species <- ifelse(data$Species == "versicolor", "versicolor/virginica", data$Species)
svm <- svm(Species ~ ., data = data, probability = TRUE)
# 生成诺莫图
Nomo <- nomogram(svm, fun = function(x) predict(svm, x, probability = TRUE)[, 2], funlabel = "Risk of SVM", lp=TRUE, se.fit=FALSE, yscale=0.5)
# 设置lims参数
lims <- list(Age = c(0, 100),
Sex = c(0, 1),
Race = c(0, 1),
# ...其他变量的取值范围
DXlung = c(0, 1))
# 绘制诺莫图
plot(Nomo, cex.axis = 0.8, col.grid = "gray", col.lines = "darkgray", col.text = "black", lty.grid = 1, lims = lims)
```
在这个修改后的代码中,lims参数被设置为一个列表,其中每个元素是一个向量,表示对应变量的取值范围。需要确保lims参数的长度与诺莫图中的变量个数相匹配。同时,注意lp和se.fit参数的设置,根据实际需要进行调整。
Nomo <- nomogram(DXliver1~Age2+ Sex2 + Race2 + Site2 + Site3 + Grade2 + Grade3 + + Grade4 + Stage2 + Stage3 + Chemotherapy2 + Income2 + Income3 + + Marital2 + Marital3 + Marital4 + DXbone2 + DXlung2,lp=F,fun.at = c(0.1, seq(0.2, 0.8, by = 0.1), 0.9), + funlabel = "Risk of SVM",data=test) Error in names(.res) <- .names : 'names' attribute [1] must be the same length as the vector [0]
这个错误通常出现在给向量或列表命名时,名称的长度与向量或列表长度不匹配。在这个代码中,可能是在设置fun.at或funlabel参数时出现了问题。
具体来说,fun.at参数应该是一个数字向量,用于在绘制图形时指定坐标轴上的位置。而funlabel参数应该是fun.at向量对应位置的标签。
在代码中,fun.at和funlabel参数的设置存在一些问题。可能是因为在fun.at中加入了多余的“+”,导致参数设置不正确。可以尝试修改代码如下:
```R
Nomo <- nomogram(DXliver1~Age2+ Sex2 + Race2 + Site2 + Site3 + Grade2 + Grade3 + Grade4 + Stage2 + Stage3 + Chemotherapy2 + Income2 + Income3 + Marital2 + Marital3 + Marital4 + DXbone2 + DXlung2, lp = F, fun.at = c(0.1, seq(0.2, 0.8, by = 0.1), 0.9), funlabel = c("Risk of SVM", rep("", 8)), data = test)
```
在这个修改后的代码中,funlabel设置为包含9个元素的字符向量,其中第一个元素为"Risk of SVM",后面8个元素为空字符串(即没有标签)。如果fun.at中包含更多的位置,需要在funlabel中设置相应的标签。
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