R语言SVM模型绘制诺莫图
时间: 2023-07-10 22:14:02 浏览: 146
要在R语言中绘制SVM模型的诺莫图,您可以使用`rms`包中的`nomogram()`函数。以下是一个简单的示例代码,演示如何使用`svm`模型和`nomogram()`函数来创建诺莫图。
首先,您需要加载`svm`包和`rms`包,以及一个示例数据集`iris`:
```R
library(svm)
library(rms)
data(iris)
```
接下来,您可以使用`svm()`函数来训练一个SVM模型,并使用`predict()`函数来生成预测值:
```R
svm.model <- svm(Species ~ ., data = iris)
svm.pred <- predict(svm.model, newdata = iris)
```
然后,您可以使用`nomogram()`函数来创建诺莫图。在这个例子中,我们将使用`plogis`函数来转换预测值,将其转换为0到1之间的概率值。我们还将使用`lp = FALSE`来指示`nomogram()`函数不使用线性预测值。
```R
Nomo <- nomogram(svm.model, fun = plogis, lp = FALSE, fun.at = c(0.1, seq(0.2, 0.8, by = 0.1), 0.9), funlabel = "Risk of SVM")
```
最后,您可以使用`plot()`函数来绘制诺莫图:
```R
plot(Nomo)
```
这将生成一个诺莫图,其中包含由`svm`模型生成的预测值的风险概率。您可以自定义该图形的外观和标签,以适应您的数据和模型。