R语言绘制SVM模型nomogram图
时间: 2023-07-10 18:14:09 浏览: 268
好的,下面是使用R语言绘制SVM模型nomogram图的示例代码:
首先,我们需要加载所需的R包:
```r
library(e1071) # 支持向量机R包
library(rms) # 包含nomogram函数的R包
library(caret) # 数据处理和建模R包
```
然后,我们需要准备我们的数据集。在这个例子中,我们将使用内置的iris数据集,并将其分为训练集和测试集:
```r
# 加载iris数据集
data(iris)
# 将数据集分为训练集和测试集
set.seed(123)
trainIndex <- createDataPartition(iris$Species, p = .8,
list = FALSE,
times = 1)
trainData <- iris[trainIndex, ]
testData <- iris[-trainIndex, ]
```
接着,我们需要训练我们的SVM模型,并使用训练集来评估模型的性能:
```r
# 训练一个线性SVM模型
svmModel <- svm(Species ~ ., data = trainData,
kernel = "linear", cost = 1)
# 在训练集上评估模型性能
trainPredictions <- predict(svmModel, trainData)
confusionMatrix(trainPredictions, trainData$Species)
```
最后,我们使用nomogram()函数绘制nomogram图:
```r
# 创建nomogram模型
svmNomogram <- nomogram(svmModel, fun = function(x) 1/(1+exp(-x)))
# 绘制nomogram图
plot(svmNomogram,
col.plot = "blue", col.points = "red",
cex.axis = 0.8, cex.lab = 0.8, cex.main = 0.8)
```
这将为我们提供一个可视化的SVM模型,其中不同变量的影响被表示为线性刻度,并且可以使用该图来预测不同类别的概率。
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