R语言绘制SVM模型的SHAP决策图
时间: 2023-07-10 22:11:50 浏览: 682
在R语言中绘制SVM模型的SHAP决策图,可以使用R的shapper包。下面是一个基本的示例代码:
```R
# 安装和加载相关的包
install.packages("shapper")
library(shapper)
# 加载数据
data(iris)
# 将鸢尾花数据集转换为二分类问题
iris$Species <- ifelse(iris$Species == "setosa", 1, 0)
# 训练SVM模型
library(e1071)
svm_model <- svm(Species ~ ., data = iris, kernel = "linear", probability = TRUE)
# 计算SHAP值
shap_values <- shap(svm_model, x = iris[, -5])
# 绘制SHAP决策图
plot(shap_values, x = iris[, -5], label = iris$Species, label.colors = c("red", "blue"))
```
在上面的代码中,首先加载了shapper包,并加载了鸢尾花数据集。然后将鸢尾花数据集转换为二分类问题,并使用svm函数训练了一个SVM模型。接下来,使用shap函数计算SVM模型的SHAP值,并使用plot函数绘制了SHAP决策图。
在绘制SHAP决策图时,通过x参数指定特征变量,通过label参数指定类别标签,通过label.colors参数指定类别标签的颜色。在本例中,红色表示"setosa"类别,蓝色表示非"setosa"类别。
阅读全文