python使用kd树找到距离p点最近的n个点
时间: 2023-10-08 12:06:53 浏览: 111
C#通过KD树进行距离最近点的查找
要使用kd树找到距离p点最近的n个点,可以使用以下步骤:
1. 构建kd树,将所有点插入到kd树中。
2. 从根节点开始,递归遍历kd树。在每个节点,根据当前节点的分裂维度和分裂值,将查询点p与节点的距离计算出来。
3. 如果当前节点的距离比当前找到的n个最近点中最远的点还要远,那么可以直接返回,不再继续递归。
4. 否则,将当前节点加入到候选最近点集合中,如果候选最近点集合的大小大于n,则需要删除最远的点。
5. 继续递归遍历当前节点的子树,直到遍历完所有的子树。
6. 最后,候选最近点集合中的所有点就是距离p点最近的n个点。
下面是一个使用kd树查找距离p点最近的n个点的Python实现:
```python
import heapq
import numpy as np
class KDTree:
def __init__(self, data):
self.data = data
self.n = data.shape[0]
self.k = data.shape[1]
self.tree = self.build_tree(0, self.n, 0)
def build_tree(self, left, right, depth):
if left >= right:
return None
mid = (left + right) // 2
axis = depth % self.k
sorted_idx = np.argsort(self.data[:, axis])
left_idx = np.where(sorted_idx[:mid] == sorted_idx[mid])[0]
right_idx = np.where(sorted_idx[mid + 1:] == sorted_idx[mid])[0] + mid + 1
node = {
"idx": sorted_idx[mid],
"axis": axis,
"left": self.build_tree(left + len(left_idx), right - len(right_idx), depth + 1),
"right": self.build_tree(left, left + len(left_idx), depth + 1)
}
return node
def search_knn(self, p, n):
candidate = []
heapq.heapify(candidate)
self.search(self.tree, p, n, candidate)
return [self.data[idx] for _, idx in heapq.nsmallest(n, candidate)]
def search(self, node, p, n, candidate):
if node is None:
return
dist = np.linalg.norm(p - self.data[node["idx"]])
if len(candidate) < n or dist < -candidate[0][0]:
heapq.heappush(candidate, (-dist, node["idx"]))
if len(candidate) > n:
heapq.heappop(candidate)
axis = node["axis"]
if p[axis] < self.data[node["idx"], axis]:
self.search(node["left"], p, n, candidate)
else:
self.search(node["right"], p, n, candidate)
if len(candidate) < n or abs(p[axis] - self.data[node["idx"], axis]) < -candidate[0][0]:
if p[axis] < self.data[node["idx"], axis]:
self.search(node["right"], p, n, candidate)
else:
self.search(node["left"], p, n, candidate)
```
上面的代码中,`KDTree`类用于构建kd树和查找最近的n个点。`build_tree`方法用于递归构建kd树。`search_knn`方法用于查找距离p点最近的n个点,其中使用了一个小根堆来维护当前找到的最近的n个点。`search`方法用于递归查找最近的n个点。
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