以下有两条序列,进行匹配,其中A对应T,C对应G。匹配规则如下匹配成功得五分,错配扣三分,空位扣四分,线性扣分。 序列1:CAATTCAGTTA 序列2:GGATCGA 请给出匹配分数最高的匹配。
时间: 2023-04-01 18:04:47 浏览: 94
DNA比对中FASTA算法的简单实现,通过建立查找表、位移表和位移向量表来得出两条序列的最大匹配位移
序列1:CAATTCAGTTA
序列2:GGATCGA--
匹配得分:
C-G:-3
A-A:5
A-T:-3
T-C:-3
C-G:-3
A-A:5
G-T:-3
T-C:-3
T-G:-3
A-A:5
总得分:-3+5-3-3-3+5-3-3-3+5= -5
因为这是唯一的匹配,所以得分最高的匹配得分为-5分。
阅读全文