用wfdb库读取mit-bih心电信号数据集提取幅值数据和标签数据,用biosppy库分析信号并剪切心拍并标记对应标签,再把每一个心拍归一化生成256*256单色位图关联标签并保存且可视化,python代码
时间: 2024-05-16 07:18:30 浏览: 175
以下是使用wfdb和biosppy库读取MIT-BIH心电信号数据集,提取幅值数据和标签数据,并使用opencv库生成归一化的单色位图关联标签的Python代码。请注意,该代码仅适用于二类分类任务,即正常心跳和异常心跳。
```python
import wfdb
import biosppy
import cv2
import numpy as np
# 读取MIT-BIH心电信号数据集
record = wfdb.rdrecord('mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0/100', sampto=5000)
annotation = wfdb.rdann('mit-bih-arrhythmia-database-1.0.0/100', 'atr', sampto=5000)
# 提取幅值数据和标签数据
signals = record.p_signal[:, 0]
labels = annotation.symbol
# 分析信号并剪切心拍并标记对应标签
out = biosppy.signals.ecg.ecg(signal=signals, show=False)
rpeaks = out['rpeaks']
beat_samples = biosppy.signals.ecg.christov_segmenter(signal=signals, rpeaks=rpeaks)[0]
beat_labels = [labels[np.where(annotation.sample == rpeak)[0][0]] for rpeak in rpeaks]
# 归一化并生成256*256单色位图关联标签
for i, beat_sample in enumerate(beat_samples):
beat = signals[beat_sample[0]:beat_sample[-1]]
beat = cv2.resize(beat, (256, 256))
beat = np.uint8((beat - np.min(beat)) / (np.max(beat) - np.min(beat)) * 255)
label = beat_labels[i]
cv2.imwrite(f'{label}_{i}.png', beat)
```
该代码首先使用wfdb库读取MIT-BIH心电信号数据集中的一个样本,并使用biosppy库分析信号并剪切心拍并标记对应标签。然后,使用opencv库将每个心拍归一化为256*256单色位图,并将其与其对应的标签保存为文件。请注意,此代码仅处理前5000个样本,您可以更改“sampto”参数以处理整个数据集。
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