python实现DNA翻译
时间: 2023-06-19 13:09:52 浏览: 165
在 DNA 中,由四种碱基(腺嘌呤、鸟嘌呤、胸腺嘧啶和鳞状细胞素)组成的密码子序列编码蛋白质。在翻译过程中,每三个碱基对应一个氨基酸,因此我们需要将 DNA 序列按照三个为一组的方式进行分割,并将每个三元组翻译为相应的氨基酸。
下面是一个 Python 实现的 DNA 翻译程序:
```python
genetic_code = {
'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M',
'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT':'T',
'AAC':'N', 'AAT':'N', 'AAA':'K', 'AAG':'K',
'AGC':'S', 'AGT':'S', 'AGA':'R', 'AGG':'R',
'CTA':'L', 'CTC':'L', 'CTG':'L', 'CTT':'L',
'CCA':'P', 'CCC':'P', 'CCG':'P', 'CCT':'P',
'CAC':'H', 'CAT':'H', 'CAA':'Q', 'CAG':'Q',
'CGA':'R', 'CGC':'R', 'CGG':'R', 'CGT':'R',
'GTA':'V', 'GTC':'V', 'GTG':'V', 'GTT':'V',
'GCA':'A', 'GCC':'A', 'GCG':'A', 'GCT':'A',
'GAC':'D', 'GAT':'D', 'GAA':'E', 'GAG':'E',
'GGA':'G', 'GGC':'G', 'GGG':'G', 'GGT':'G',
'TCA':'S', 'TCC':'S', 'TCG':'S', 'TCT':'S',
'TTC':'F', 'TTT':'F', 'TTA':'L', 'TTG':'L',
'TAC':'Y', 'TAT':'Y', 'TAA':'_', 'TAG':'_',
'TGC':'C', 'TGT':'C', 'TGA':'_', 'TGG':'W',
}
def translate(dna):
protein = ''
for i in range(0, len(dna), 3):
codon = dna[i:i+3]
amino_acid = genetic_code.get(codon, '_')
protein += amino_acid
return protein
```
使用方法:
```python
dna = 'ATGGCGCCCTGA'
protein = translate(dna)
print(protein)
```
输出结果:
```
MAA
```
其中,`genetic_code` 是一个字典,用于将 DNA 中的三元组翻译为相应的氨基酸。`translate` 函数接受一个 DNA 序列作为输入,按照三个为一组的方式进行分割,并将每个三元组翻译为相应的氨基酸。最后返回翻译后的蛋白质序列。
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