什么意思Error in kable(summary(log.step)$coefficients, align = "c", caption = "Logistic Regression Results") %>% : could not find function "%>%"
时间: 2023-07-21 08:05:51 浏览: 58
这个错误提示说明在你的代码中没有加载 `%>%` 这个函数所在的包,你需要在代码中先加载这个包。`%>%` 函数是 `magrittr` 包中的函数,你可以使用以下代码加载该包:
```
library(magrittr)
```
如果你已经加载了 `magrittr` 包,但是还是出现了这个错误,那么可能是你的 R 版本过低,需要升级到支持 `%>%` 函数的版本。
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getwd() setwd( "/Users/jasmma/abl") zxb=read.csv("zxb111.csv") log<-glm(frail~age+txl+BMI+ag+tx+BM+address+sex+marriage+live+smoking+drink+exercise+education+primary+DM+HP+Hrart +Cero+com+pro+income+follow+depress+anxiety+RBC+Hb+HCT+fe+Ca+P+iPTH+alb+cr+bun+com1,family = binomial,data = zxb) summary(log) log.step<-step(log) summary(log.step) # ##############制作表格######## install.packages(c("stats", "MASS", "car", "tidyverse", "knitr", "kableExtra")) library(stats) library(MASS) library(car) library(tidyverse) library(knitr) library(kableExtra) kable(summary(log.step)$coefficients, align = "c", caption = "Logistic Regression Results") %>% kable_styling(bootstrap_options = "hover", full_width = F) %>% column_spec(1, bold = T) %>% column_spec(4, color = "white", background = "steelblue") ############### 将结果转化为表格形式##### result <- data.frame( variable = names(log.step$coefficients)[-1], # 变量名称 beta = coef(log.step)[-1], # β系数 wald_stat = summary(log.step)$coefficients[-1, "z"], # Wald统计量 se = summary(log.step)$coefficients[-1, "Std. Error"], # 标准误差 or = exp(coef(log.step)[-1]), # 比值比 ci_low = exp(confint(log.step)[-1, 1]), # 置信区间下限 ci_high = exp(confint(log.step)[-1, 2]), # 置信区间上限 p_value = summary(log.step)$coefficients[-1, "Pr(>|z|)"] # P值 )
这段代码是进行 logistic 回归分析的,包括数据读入、模型拟合、模型选择以及结果展示等步骤。其中,使用step()函数进行模型选择,生成的模型结果通过summary()函数进行总结统计,并通过kable()和kableExtra()函数将结果转化为表格形式进行展示。最后,将结果保存到result数据框中。
用R语言进行多因素逻辑回归分析,并将分析结果制备为文献发表格式表格
以下是用R语言进行多因素逻辑回归分析,并制备成文献发表格式表格的步骤:
1. 准备数据集
首先需要准备好数据集,包括自变量和因变量。数据集可以通过读取文件或手动输入数据的方式获取。
2. 安装和加载相关包
需要安装和加载以下包:stats、MASS、car、tidyverse、knitr和kableExtra。
```
install.packages(c("stats", "MASS", "car", "tidyverse", "knitr", "kableExtra"))
library(stats)
library(MASS)
library(car)
library(tidyverse)
library(knitr)
library(kableExtra)
```
3. 进行多因素逻辑回归分析
使用glm函数进行多因素逻辑回归分析。
```
model <- glm(dependent_variable ~ independent_variable_1 + independent_variable_2 + independent_variable_3, data = dataset, family = "binomial")
```
其中dependent_variable是因变量,independent_variable_1、independent_variable_2和independent_variable_3是自变量,dataset是数据集。
4. 模型诊断
使用summary函数对模型进行诊断。
```
summary(model)
```
5. 制作表格
使用kable和kableExtra函数制作表格。
```
kable(summary(model)$coefficients, align = "c", caption = "Logistic Regression Results") %>%
kable_styling(bootstrap_options = "hover", full_width = F) %>%
column_spec(1, bold = T) %>%
column_spec(4, color = "white", background = "steelblue")
```
以上代码会将模型结果制作成表格,并加上标题和样式。
完整代码如下:
```
# 准备数据集
dataset <- read.csv("data.csv")
# 安装和加载相关包
install.packages(c("stats", "MASS", "car", "tidyverse", "knitr", "kableExtra"))
library(stats)
library(MASS)
library(car)
library(tidyverse)
library(knitr)
library(kableExtra)
# 进行多因素逻辑回归分析
model <- glm(dependent_variable ~ independent_variable_1 + independent_variable_2 + independent_variable_3, data = dataset, family = "binomial")
# 模型诊断
summary(model)
# 制作表格
kable(summary(model)$coefficients, align = "c", caption = "Logistic Regression Results") %>%
kable_styling(bootstrap_options = "hover", full_width = F) %>%
column_spec(1, bold = T) %>%
column_spec(4, color = "white", background = "steelblue")
```
注意,需要将"data.csv"替换成实际的数据文件名,以及将dependent_variable、independent_variable_1、independent_variable_2和independent_variable_3替换成实际变量名。