什么意思Error in kable(summary(log.step)$coefficients, align = "c", caption = "Logistic Regression Results") %>% : could not find function "%>%"
时间: 2023-07-21 14:05:51 浏览: 215
这个错误提示说明在你的代码中没有加载 `%>%` 这个函数所在的包,你需要在代码中先加载这个包。`%>%` 函数是 `magrittr` 包中的函数,你可以使用以下代码加载该包:
```
library(magrittr)
```
如果你已经加载了 `magrittr` 包,但是还是出现了这个错误,那么可能是你的 R 版本过低,需要升级到支持 `%>%` 函数的版本。
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getwd() setwd( "/Users/jasmma/abl") zxb=read.csv("zxb111.csv") log<-glm(frail~age+txl+BMI+ag+tx+BM+address+sex+marriage+live+smoking+drink+exercise+education+primary+DM+HP+Hrart +Cero+com+pro+income+follow+depress+anxiety+RBC+Hb+HCT+fe+Ca+P+iPTH+alb+cr+bun+com1,family = binomial,data = zxb) summary(log) log.step<-step(log) summary(log.step) # ##############制作表格######## install.packages(c("stats", "MASS", "car", "tidyverse", "knitr", "kableExtra")) library(stats) library(MASS) library(car) library(tidyverse) library(knitr) library(kableExtra) kable(summary(log.step)$coefficients, align = "c", caption = "Logistic Regression Results") %>% kable_styling(bootstrap_options = "hover", full_width = F) %>% column_spec(1, bold = T) %>% column_spec(4, color = "white", background = "steelblue") ############### 将结果转化为表格形式##### result <- data.frame( variable = names(log.step$coefficients)[-1], # 变量名称 beta = coef(log.step)[-1], # β系数 wald_stat = summary(log.step)$coefficients[-1, "z"], # Wald统计量 se = summary(log.step)$coefficients[-1, "Std. Error"], # 标准误差 or = exp(coef(log.step)[-1]), # 比值比 ci_low = exp(confint(log.step)[-1, 1]), # 置信区间下限 ci_high = exp(confint(log.step)[-1, 2]), # 置信区间上限 p_value = summary(log.step)$coefficients[-1, "Pr(>|z|)"] # P值 )
这段代码是进行 logistic 回归分析的,包括数据读入、模型拟合、模型选择以及结果展示等步骤。其中,使用step()函数进行模型选择,生成的模型结果通过summary()函数进行总结统计,并通过kable()和kableExtra()函数将结果转化为表格形式进行展示。最后,将结果保存到result数据框中。
R语言导出summary结果
在R语言中,当你对数据集或模型进行了分析并得到了`summary()`函数的结果后,你可以将这些总结信息保存到文件以便于后续查看或者分享。通常有几种方法可以完成这个任务:
1. **文本文件**:可以直接使用`write.table()`或`cat()`函数将`summary()`的结果写入`.txt`文件。例如:
```r
summary_result <- summary(your_data_frame) # 先获取结果
write.table(summary_result, "your_file.txt", row.names = FALSE, quote = FALSE)
```
2. **CSV文件**:使用`write.csv()`函数将结果转换为CSV格式:
```r
write.csv(summary_result, "summary_output.csv", row.names = FALSE)
```
3. **Markdown**或**HTML**:如果你希望格式化输出,可以使用`knitr`包配合`kableExtra`包将结果转成Markdown或HTML格式,然后写入文件:
```r
library(knitr)
library(kableExtra)
kable(summary_result) %>%
kable_styling() -> output
saveRDS(output, "summary_report.RDS") # 或者 writeLines(output, "summary_report.md")
```
4. **RData格式**:如果你想保留完整的R对象结构,可以使用`saveRDS()`函数保存:
```r
saveRDS(summary_result, "summary_results.rds")
```
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