本地blast的使用llinux

要在Linux系统上使用本地BLAST，需要先下载和安装NCBI BLAST软件包。可以从NCBI官网上下载最新版本的BLAST软件包，并按照官方文档中的说明进行安装。

安装完成后，可以使用以下命令运行本地BLAST：

blastn -query input.fasta -db database -out output.txt -outfmt 6

其中，`input.fasta`是查询序列，`database`是需要比对的数据库，`output.txt`是输出文件名，`-outfmt 6`指定输出格式为tabular格式。根据需要，可以修改输出格式和参数。

除了`blastn`外，还有其他类型的BLAST可供使用，比如`tblastx`、`blastp`、`blastx`等，具体使用方法可以参考官方文档。