使用图坍缩,代码实现图级分类

时间: 2023-12-02 22:04:45 浏览: 34
图坍缩(Graph Coarsening)是将原始图中的节点合并成较大的节点,从而得到一个更小的图的过程。在图级分类问题中,我们可以先将原始图进行坍缩,得到一个更小的图,然后对这个更小的图进行分类,最后再根据分类结果将原始图的节点分配到不同的类别中。 以下是一个基于图坍缩的图级分类的示例代码: ```python import networkx as nx import numpy as np from sklearn.cluster import KMeans def coarsen(A, levels): graphs, parents = [A], [] for i in range(levels): # 计算相邻节点的相似度 adj = graphs[-1] A = adj + np.eye(adj.shape[0]) D = np.sum(A, axis=1) D_inv = np.diag(1 / np.sqrt(D)) S = D_inv @ A @ D_inv # 使用 KMeans 对节点进行聚类 kmeans = KMeans(n_clusters=adj.shape[0] // 2).fit(S) new_adj = np.zeros((kmeans.labels_.max() + 1, kmeans.labels_.max() + 1)) for j in range(adj.shape[0]): new_adj[kmeans.labels_[j], kmeans.labels_[adj[j].nonzero()[1]]] += 1 new_adj += np.eye(new_adj.shape[0]) # 去除孤立节点 new_adj = new_adj[new_adj.sum(axis=1) > 0][:, new_adj.sum(axis=0) > 0] graphs.append(new_adj) parents.append(kmeans.labels_) return graphs, parents def coarsened_adjacency_matrix(A, parents): coarsened_A = A.copy() for parent in parents: coarsened_A = parent[coarsened_A] return coarsened_A # 构建原始图 G = nx.karate_club_graph() A = nx.adjacency_matrix(G).toarray() # 图坍缩 graphs, parents = coarsen(A, levels=3) # 对每个更小的图进行分类 num_classes = 2 for i, graph in enumerate(graphs): coarsened_A = coarsened_adjacency_matrix(A, parents[:i]) labels = KMeans(n_clusters=num_classes).fit_predict(coarsened_A) print(f"Level {i}: {labels}") ``` 该代码首先构建了一个 Karate Club Graph,然后对其进行了 3 层坍缩。对于每个更小的图,我们使用 KMeans 算法将节点分为两个类别,并输出结果。这里仅供参考,实际应用中可能需要根据具体情况进行调整。

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