totalplot<-cowplot::plot_grid(plotlist=plotlist,ncol=1) Error in `geom_line()`: ! Problem while computing aesthetics. ℹ Error occurred in the 2nd layer. Caused by error in `FUN()`: ! object 'EMD' not found Run `rlang::last_trace()` to see where the error occurred.

根据错误提示，似乎出现了一个"EMD not found" 的错误，可能是由于没有加载或者创建 `EMD` 对象。你需要检查一下代码中是否有创建 `EMD` 对象的语句，或者在运行这段代码之前是否已经加载了包含 `EMD` 对象的数据或者文件。同时，你也可以运行 `rlang::last_trace()` 命令来查看更详细的错误信息，以便更好地定位问题所在。

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Backtrace: ▆ 1. └─cowplot::plot_grid(plotlist = plotlist, ncol = 1) 2. └─cowplot::align_plots(...) 3. └─base::lapply(...) 4. └─cowplot (local) FUN(X[[i]], ...) 5. ├─cowplot::as_gtable(x) 6. └─cowplot:::as_gtable.default(x) 7. ├─cowplot::as_grob(plot) 8. └─cowplot:::as_grob.ggplot(plot) 9. └─ggplot2::ggplotGrob(plot) 10. ├─ggplot2::ggplot_gtable(ggplot_build(x)) 11. │ └─ggplot2:::attach_plot_env(data$plot$plot_env) 12. │ └─base::options(ggplot2_plot_env = env) 13. ├─ggplot2::ggplot_build(x) 14. └─ggplot2:::ggplot_build.ggplot(x) 15. └─ggplot2:::by_layer(...) 16. ├─rlang::try_fetch(...) 17. │ ├─base::tryCatch(...) 18. │ │ └─base (local) tryCatchList(expr, classes, parentenv, handlers) 19. │ │ └─base (local) tryCatchOne(expr, names, parentenv, handlers[[1L]]) 20. │ │ └─base (local) doTryCatch(return(expr), name, parentenv, handler) 21. │ └─base::withCallingHandlers(...) 22. └─ggplot2 (local) f(l = layers[[i]], d = data[[i]]) 23. └─l$compute_aesthetics(d, plot) 24. └─ggplot2 (local) compute_aesthetics(..., self = self) 25. └─base::lapply(aesthetics, eval_tidy, data = data, env = env) 26. └─rlang (local) FUN(X[[i]], ...)

根据你提供的 `Backtrace` 信息，可以看出问题出在 `cowplot::plot_grid()` 函数中，具体是在运行 `cowplot::align_plots()` 函数时出现了问题。在 `align_plots()` 函数中，使用 `lapply()` 函数对 `plotlist` 中的每个元素应用了一个函数，但是这个函数中可能出现了一些错误。你需要检查一下自己的代码中是否有对 `plotlist` 进行了修改或者处理，导致其中的元素出现了错误，或者尝试使用 `rlang::last_trace()` 命令来查看更详细的错误信息，以便更好地定位问题所在。

> plot_grid(p1, p2, ncol = 2, align = "h", axis = "tb") Error in `geom_boxplot()`: ! Problem while computing aesthetics. ℹ Error occurred in the 1st layer. Caused by error in `FUN()`: ! object 'Sepal.Length' not found Run `rlang::last_trace()` to see where the error occurred.

这个错误提示说找不到 `Sepal.Length` 这个对象，很可能是因为 `Sepal.Length` 这个变量名没有定义或者拼写错误。请检查一下代码中是否有定义这个变量，或者确认变量名是否正确。如果问题仍然存在，可以使用 `rlang::last_trace()` 命令来查看错误的具体位置和原因。