heatmap不显示行名
时间: 2024-04-01 20:28:14 浏览: 285
你可以使用ComplexHeatmap包中的show_row_names参数来控制是否显示行名。将show_row_names参数设置为FALSE即可实现heatmap不显示行名的效果。
以下是一个示例代码:
```R
library(ComplexHeatmap)
# 创建一个示例矩阵
A <- matrix(1:12, nrow = 4)
# 将矩阵转化为matrix对象
A <- as.matrix(A)
# 设置样本分组信息
samples <- rep(c('Control', 'Treat'), c(2, 2))
# 对数据进行标准化处理
for (i in 1:nrow(A)) {
A[i, ] <- scale(log(unlist(A[i, ] + 1), 2))
}
# 绘制热图
Heatmap(A,
col = colorRampPalette(c("navy", "white", "firebrick3"))(100),
show_row_names = FALSE, # 不显示行名
top_annotation = HeatmapAnnotation(Group = samples,
simple_anno_size = unit(2, 'mm'),
col = list(Group = c('Control' = '#00DAE0', 'Treat' = '#FF9289')),
show_annotation_name = FALSE)
)
```
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