R语言支持向量机怎么画校准曲线
时间: 2024-10-01 22:11:15 浏览: 69
在R语言中,通过`caret`包和`pROC`包可以绘制支持向量机(SVM)的校准曲线,这有助于评估模型的预测性能。校准曲线显示了模型预测的概率(通常是SVM的置信度分数)与实际类别概率之间的关系。以下是基本步骤:
1. 首先,确保已安装`caret`和`pROC`包,如果没有,可以使用`install.packages(c("caret", "pROC"))`进行安装。
```R
library(caret)
library(pROC)
```
2. 准备数据集,包括特征和响应变量。假设你有一个名为`data`的数据框,其中包含`predictors`列(特征)和`response`列(目标变量)。
```R
# 假设data是一个数据框
data <- read.csv("your_data.csv") # 替换为你的数据文件路径
set.seed(123) # 设置随机种子以便结果可复现
trainIndex <- createDataPartition(data$response, p = .7, list = FALSE)
trainData <- data[trainIndex, ]
testData <- data[-trainIndex, ]
```
3. 使用`train()`函数训练SVM模型,并计算预测概率。
```R
svmModel <- train(response ~ predictors, data = trainData, method = "svmLinear", preProcess = c("center", "scale"), trControl = trainControl(method = "cv", number = 5))
predProb <- predict(svmModel, testData, type = "prob")
```
4. 使用`pROC::roc()`函数创建校准曲线,并使用`plot.calibration()`展示。
```R
calPlot <- roc(predProb[,2], testData$response, plot = TRUE, print.cutoffs = TRUE)
calPlot$call[[3]]$col <- ifelse(calPlot$call[[3]]$y > 0.5, "blue", "red") # 给正类和负类的概率上色
```
5. 查看和分析校准曲线,观察预测概率是否接近实际概率,斜率越接近45度线,表示模型越好。
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