RNA测序下机清理数据和序列对比

RNA测序下机清理数据和序列对比是RNA测序分析的重要步骤。下机数据清理是指去除低质量序列、接头序列和污染序列等，保留高质量的RNA测序数据。常用的清理工具有Trimmomatic、Cutadapt和fastp等。序列对比是指将RNA测序数据与基因组或转录组进行比对，以确定RNA测序reads的来源和表达量。常用的比对工具有Hisat2、STAR和TopHat等。这些工具可以帮助研究人员在RNA测序数据中准确识别基因型和表达型的变化，从而更好地理解基因的功能和生物学过程。