批量预测蛋白质二级结构的软件
时间: 2023-09-30 18:07:40 浏览: 400
有很多软件可以用于批量预测蛋白质的二级结构,以下是几个常用的软件:
1. PSIPRED:一种广泛使用的二级结构预测软件,可以通过提交蛋白质序列或使用本地安装的程序来运行。
2. JPred:一个在线工具,可以通过提交蛋白质序列进行二级结构预测。它使用了多种方法,包括神经网络和支持向量机等。
3. SOPMA:一个在线工具,可以用于预测蛋白质的二级结构,并且还可以预测蛋白质的其他结构属性,如残基可及性和二硫键等。
4. GOR IV:一种基于统计模型的二级结构预测方法,可以在本地运行或使用在线版本。
5. DSSP:一个程序,可以通过处理PDB文件来确定蛋白质的二级结构。它可以用于处理单个结构或批量处理多个结构。
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