层次聚类算法python
时间: 2023-10-23 09:45:16 浏览: 111
你好!关于层次聚类算法python的问题,我可以回答。层次聚类是一种聚类方法,它是通过不断合并具有最小距离的两个簇来构建完整的聚类树,从而完成聚类过程的。在Python中,我们可以使用scikit-learn库来实现层次聚类算法。具体实现方法可以查看相关文档或者参考相关书籍。希望我的回答能对你有所帮助!
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层次聚类算法python代码
层次聚类算法的Python代码可以使用scipy库中的hierarchy模块实现。以下是一个简单的示例代码:
```python
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
# 生成随机数据
np.random.seed(4711)
a = np.random.multivariate_normal([10, 0], [[3, 1], [1, 4]], size=[100,])
b = np.random.multivariate_normal([0, 20], [[3, 1], [1, 4]], size=[50,])
X = np.concatenate((a, b),)
# 生成层次聚类树
Z = linkage(X, 'ward')
# 绘制层次聚类树
plt.figure(figsize=(25, 10))
plt.title('Hierarchical Clustering Dendrogram')
plt.xlabel('sample index')
plt.ylabel('distance')
dendrogram(Z, leaf_rotation=90., leaf_font_size=8.)
plt.show()
```
这段代码生成了一个包含150个数据点的随机数据集,并使用Ward方法进行层次聚类。最后,它绘制了一个层次聚类树,其中每个叶子节点代表一个数据点,每个内部节点代表一个聚类。
层次聚类算法python实现
层次聚类是一种无监督学习算法,它可以将数据集中的样本分成具有相似性的若干个簇。以下是使用Python实现层次聚类算法的示例代码:
```
import numpy as np
from scipy.spatial.distance import pdist
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram, linkage
# 生成一个样本数据集
X = np.array([[1, 2], [1.5, 1.8], [5, 8], [8, 8], [1, 0.6], [9, 11]])
# 计算距离矩阵
dist_matrix = pdist(X)
# 使用“ward”方法进行层次聚类
Z = linkage(dist_matrix, 'ward')
# 生成树状图
dendrogram(Z)
# 显示树状图
import matplotlib.pyplot as plt
plt.show()
```
在上面的代码中,我们首先生成了一个样本数据集,然后使用`pdist`函数计算距离矩阵。接着,我们使用`linkage`函数使用“ward”方法进行层次聚类。最后,我们使用`dendrogram`函数生成树状图并使用`matplotlib`库显示出来。
需要注意的是,由于层次聚类算法的时间复杂度较高,因此对于大规模数据集的应用,可能需要使用其他更加高效的算法。
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