def read(pat, freq=1. / 200, cut_hours=0): hours = cut_hours string = 'PatID%d' % pat for files in os.walk(string): # if dp-file does not exist f = sorted(files[2]) CSF = f[0] Ventricles = f[1] toss = 1. / freq * 2 * 60 * 60 dp, p1, p2 = filters(string + '/' + CSF, string + '/' + Ventricles) if hours != 0: dp, p1, p2 = dp[toss:-toss * hours], p1[toss:-toss * hours], p2[toss:-toss * hours] daytime = CSF.split('_')[3] t0 = float(daytime[:2]) * 3600 + float(daytime[2:4]) * 60 + float(daytime[4:]) + 2 * 60 * 60 t1 = t0 + (len(dp) - 1) * freq T = (len(dp) - 1) * freq t = linspace(0, T, len(dp)) return daytime, t, dp, p1, p2解释代码
时间: 2024-04-07 18:29:45 浏览: 53
这段代码是一个Python函数,函数名为read,接收三个参数pat、freq和cut_hours。
函数首先将字符串'PatID%d' % pat与当前目录下的子目录名拼接起来,作为输入文件的路径。
然后通过os.walk函数遍历该目录及其子目录,找到其中名为CSF和Ventricles的两个文件。
接下来,函数调用filters函数对这两个文件进行滤波处理,得到dp、p1和p2三个数组。
如果cut_hours参数不为0,则从dp、p1和p2中截取掉前toss * cut_hours个数据点。
接着,函数从CSF文件名中提取出时间信息,计算出数据采样起始时间t0和采样结束时间t1,以及总共采样的时间长度T。
最后,函数使用linspace函数生成从0到T的等差数列t,并将计算出的时间序列t、dp、p1和p2返回。
相关问题
def low_pass_filter(y, sr, cutoff_freq): nyq_freq = sr / 2 norm_cutoff_freq = cutoff_freq / nyq_freq b, a = signal.butter(4, norm_cutoff_freq, 'low') return signal.filtfilt(b, a, y) y_low_pass = low_pass_filter(y, sr, 500) # 普通滤波
这段代码实现了一个低通滤波器,可以通过指定截止频率来滤除高频信号,从而达到降噪的效果。具体的实现过程如下:
1. 计算采样率的一半,即Nyquist频率。
2. 将所需的截止频率转化为归一化频率,即除以Nyquist频率。
3. 使用signal.butter函数设计一个4阶低通滤波器,得到滤波器系数b和a。
4. 使用signal.filtfilt函数对输入信号y进行滤波,得到滤波后的输出信号y_low_pass。
其中,signal.butter函数是利用巴特沃斯滤波器设计方法生成滤波器系数的函数,signal.filtfilt函数是利用前向-后向滤波器实现的零相移滤波函数,可以有效避免相位失真的问题。
在上述代码中,我们通过调用low_pass_filter函数,将输入信号y和采样率sr以及所需的截止频率cutoff_freq作为参数传递给函数,函数返回低通滤波后的输出信号y_low_pass。具体使用时,我们可以将y_low_pass作为下一步滤波方法的输入信号。
优化这段import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt %config InlineBackend.figure_format='retina' def generate_signal(t_vec, A, phi, noise, freq): Omega = 2*np.pi*freq return A * np.sin(Omega*t_vec + phi) + noise * (2*np.random.random def lock_in_measurement(signal, t_vec, ref_freq): Omega = 2*np.pi*ref_freq ref_0 = 2*np.sin(Omega*t_vec) ref_1 = 2*np.cos(Omega*t_vec) # signal_0 = signal * ref_0 signal_1 = signal * ref_1 # X = np.mean(signal_0) Y = np.mean(signal_1) # A = np.sqrt(X**2+Y**2) phi = np.arctan2(Y,X) print("A=", A, "phi=", phi) # t_vec = np.linspace(0, 0.2, 1001) A = 1 phi = np.pi noise = 0.2 ref_freq = 17.77777 # signal = generate_signal(t_vec, A, phi, noise, ref_freq) # lock_in_measurement(signal, t_vec, ref_freq)
你可以优化这段代码的一些地方。首先,你可以将import语放在代码的开,这样可以更清晰地看到你使用了哪些库。其次,你可以将生成信号和锁相测量的函数封装到一个类中,这样可以更好地组织代码。最后,你可以将生成信号和锁相测量的参数作为函数的参数传递进去,而不是在函数内部硬编码。这样可以增加代码的灵活性。以下是优化后的代码示例:
```python
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
class SignalGenerator:
def __init__(self, t_vec, A, phi, noise, freq):
self.t_vec = t_vec
self.A = A
self.phi = phi
self.noise = noise
self.freq = freq
def generate_signal(self):
Omega = 2*np.pi*self.freq
return self.A * np.sin(Omega*self.t_vec + self.phi) + self.noise * (2*np.random.random)
def lock_in_measurement(self, signal, ref_freq):
Omega = 2*np.pi*ref_freq
ref_0 = 2*np.sin(Omega*self.t_vec)
ref_1 = 2*np.cos(Omega*self.t_vec)
signal_0 = signal * ref_0
signal_1 = signal * ref_1
X = np.mean(signal_0)
Y = np.mean(signal_1)
A = np.sqrt(X**2 + Y**2)
phi = np.arctan2(Y, X)
print("A=", A, "phi=", phi)
# 示例使用
t_vec = np.linspace(0, 0.2, 1001)
A = 1
phi = np.pi
noise = 0.2
ref_freq = 17.77777
generator = SignalGenerator(t_vec, A, phi, noise, ref_freq)
signal = generator.generate_signal()
generator.lock_in_measurement(signal, ref_freq)
```
这样,你可以更方便地复用代码,并且可以通过修改构造函数的参数来调整生成信号和锁相测量的设置。
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