用Python完成对鸢尾花数据集的K-medoids聚类并绘图
时间: 2024-02-07 13:02:54 浏览: 127
好的,对于 K-medoids 聚类算法,在 Python 中可以使用 PyClustering 库来实现。我们可以使用 `kmedoids` 函数来定义模型,然后使用 `fit` 方法拟合模型并输出聚类结果。具体实现步骤如下:
```python
# 导入必要的库和数据集
from sklearn.datasets import load_iris
from pyclustering.cluster.kmedoids import kmedoids
import matplotlib.pyplot as plt
iris = load_iris()
X = iris.data
# 定义聚类模型,这里设置聚类数为3
kmedoids_instance = kmedoids(X, [0, 50, 100], data_type='points')
# 训练模型并输出聚类结果
kmedoids_instance.process()
clusters = kmedoids_instance.get_clusters()
# 绘制散点图
colors = ['r', 'g', 'b']
for i, cluster in enumerate(clusters):
plt.scatter(X[cluster, 0], X[cluster, 1], c=colors[i])
plt.xlabel('Sepal length')
plt.ylabel('Sepal width')
plt.show()
```
这段代码中,我们首先使用 `load_iris()` 函数导入鸢尾花数据集,并将其赋给变量 `iris`。然后,我们从 `iris` 中取出数据,赋给变量 `X`。
接着,我们使用 `kmedoids` 函数定义了一个 K-medoids 聚类模型,将聚类数设置为3,并将初始质心点的索引设置为 `[0, 50, 100]`。这里需要注意的是,K-medoids 算法需要手动指定初始质心点的位置,这里我们简单地指定前三个数据点为初始质心点。
然后,我们使用 `process()` 方法拟合模型,并使用 `get_clusters()` 方法获取聚类结果。
最后,我们使用 Matplotlib 库绘制散点图,其中不同聚类的数据点使用不同的颜色进行标记。由于 K-medoids 算法与 KMeans 算法不同,它不是基于距离的聚类算法,而是基于对象之间的相似性度量,因此在这个例子中,我们只使用了前两个特征作为坐标轴进行可视化。
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