如何在Python中使用k-medoids算法对鸢尾花数据集进行聚类并评估准确率
时间: 2024-09-13 10:04:35 浏览: 65
在Python中使用k-medoids算法对鸢尾花数据集进行聚类并评估准确率可以通过以下步骤完成:
首先,需要安装`pam clustering`库,因为scikit-learn库中没有直接提供k-medoids算法的实现。可以使用pip安装命令:
```bash
pip install pam-clustering
```
接着,导入必要的库,并加载鸢尾花数据集:
```python
import numpy as np
from sklearn import datasets
from sklearn.metrics import accuracy_score
from sklearn.preprocessing import LabelEncoder
from sklearn.preprocessing import scale
from pam import cluster
# 加载鸢尾花数据集
iris = datasets.load_iris()
X = iris.data
y = iris.target
```
由于k-medoids算法要求数据集的特征必须是数值型,而且需要进行归一化处理:
```python
X_scaled = scale(X)
```
使用k-medoids算法对数据集进行聚类:
```python
# 设置聚类的数量,鸢尾花数据集有3个种类
n_clusters = 3
# 应用k-medoids算法
kmedoids = cluster.KMedoids(n_clusters=n_clusters)
kmedoids.fit(X_scaled)
```
获取聚类标签:
```python
kmedoid_labels = kmedoids.labels_
```
由于鸢尾花数据集是已经标记好的数据集,我们可以使用标签编码器(LabelEncoder)来将聚类结果的标签转换成对应的鸢尾花种类,并计算准确率:
```python
# 转换原始标签为数值标签
label_encoder = LabelEncoder()
y_encoded = label_encoder.fit_transform(y)
# 转换聚类标签为数值标签
kmedoid_labels_encoded = label_encoder.fit_transform(kmedoid_labels)
# 计算准确率
accuracy = accuracy_score(y_encoded, kmedoid_labels_encoded)
print(f'准确率: {accuracy * 100:.2f}%')
```
以上步骤展示了如何在Python中应用k-medoids算法对鸢尾花数据集进行聚类并评估准确率。需要强调的是,准确率是聚类性能评估的一个指标,通常用于监督学习场景。在聚类(无监督学习)中,通常使用轮廓系数、Davies-Bouldin指数等其他指标来评估聚类效果。
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