verboseScatterplot(abs(geneModuleMembership[moduleGenes,column]), + abs(geneTraitsignificance[moduleGenes,1]), + x1ab = paste("Module Membership in", module, "module"), + ylab = "Gene significance for pathological type", + main =paste("Module membership vs.gene significance\n"), + cex.main = 1.2,#主标题的字体大小。 + cex.lab=1.2, #标签的字体大小。 + cex.axis =1.2, #坐标轴刻度的字体大小。 + co1="skyblue", #散点图中散点的颜色。 + abline=FALSE, #是否给制一条辅助直线。 + lmFnc=lm, #用子计算回归线的数。 + pch=1) #散点图中散点的形状。 There were 12 warnings (use warnings() to see them)
时间: 2024-02-10 07:27:56 浏览: 36
这是一段 R 语言代码,用于绘制散点图。它使用了 `verboseScatterplot` 函数,并提供了一些参数来自定义图形的外观和标签。
这段代码的目的是绘制一个散点图,其中 x 轴表示基因模块成员关系的绝对值,y 轴表示基因在病理类型中的显著性的绝对值。图表的标题为 "Module membership vs. gene significance", x 轴标签为 "Module Membership in [module] module"([module] 是一个占位符,应替换为实际的模块名称), y 轴标签为 "Gene significance for pathological type"。
这段代码还使用了一些参数来调整图表的显示样式,如标题字体大小 `cex.main`、标签字体大小 `cex.lab`、坐标轴刻度字体大小 `cex.axis`、散点颜色 `col`、是否绘制辅助直线 `abline`、计算回归线的函数 `lmFnc` 和散点形状 `pch`。
警告信息(There were 12 warnings)提示你的代码可能存在一些潜在的问题。你可以使用 `warnings()` 函数查看这些警告信息的具体内容,以便进一步调试和修复问题。
请注意,在运行这段代码之前,确保已经正确定义了相关变量(如 `geneModuleMembership`、`geneTraitSignificance`、`moduleGenes` 和 `column`),并且这些变量包含了正确的数据。如果代码仍然出现问题,建议检查变量名称和数据类型是否正确,以及确保所有的变量都已经正确加载。
希望这个解答对你有所帮助。如果你还有其他问题,请随时提问。