sparkmllib实现kmeans聚类
时间: 2023-06-22 17:25:02 浏览: 171
好的,下面是 sparkmllib 实现 kmeans 聚类的步骤:
1. 导入相关库和数据
```python
from pyspark.ml.clustering import KMeans
from pyspark.ml.evaluation import ClusteringEvaluator
# 加载数据
dataset = spark.read.format("libsvm").load("data/mllib/sample_kmeans_data.txt")
```
2. 训练模型
```python
# 设置 k 值
kmeans = KMeans().setK(2).setSeed(1)
model = kmeans.fit(dataset)
```
3. 预测结果
```python
# 预测结果
predictions = model.transform(dataset)
```
4. 评估模型
```python
# 评估模型
evaluator = ClusteringEvaluator()
silhouette = evaluator.evaluate(predictions)
print("Silhouette with squared euclidean distance = " + str(silhouette))
```
以上就是 sparkmllib 实现 kmeans 聚类的基本步骤,需要注意的是,我们需要设置 k 值,即聚类的数量,还需要评估模型的好坏,这里使用的是 Silhouette 系数。
相关问题
西瓜数据集(watermelon.txt)各个特征的含义如下: 数据集的每一行由3个数值组成,前2个数字用\t分隔,后2个数字用空格分隔。 对于数据集文件watermelon.txt,请编写MapReduce程序,同时采用密度和含糖率数据作为特征,设类别数为2,利用 K-Means 聚类方法通过多次迭代对数据进行聚类。不使用第三方库,选取合适的Spark RDD转换算子和行动算子实现Kmeans算法,完成实验内容; 5. 基于Spark MLlib,实现Kmeans聚类计算,利用idea写出完整代码
首先,我们需要将watermelon.txt文件中的数据读入Spark中,并将密度和含糖率作为特征进行聚类。以下是实现该任务的代码:
```scala
import org.apache.spark.{SparkConf, SparkContext}
import org.apache.spark.mllib.clustering.{KMeans, KMeansModel}
import org.apache.spark.mllib.linalg.Vectors
object KMeansExample {
def main(args: Array[String]): Unit = {
val conf = new SparkConf().setAppName("KMeansExample").setMaster("local")
val sc = new SparkContext(conf)
// 读取数据
val data = sc.textFile("watermelon.txt")
.map(line => {
val parts = line.split("\t")
Vectors.dense(parts(0).toDouble, parts(1).toDouble)
}).cache()
// 聚类数为2,最大迭代次数为20
val numClusters = 2
val numIterations = 20
// 训练模型
val clusters = KMeans.train(data, numClusters, numIterations)
// 输出聚类结果
println("Cluster centers:")
clusters.clusterCenters.foreach(println)
// 保存模型
clusters.save(sc, "myModelPath")
// 加载模型
val sameModel = KMeansModel.load(sc, "myModelPath")
sc.stop()
}
}
```
上述代码通过`textFile`方法将watermelon.txt文件中的数据读入Spark中,并使用`map`方法将每行数据转换为一个稠密向量(dense vector),其中第一个数值表示密度,第二个数值表示含糖率。然后,我们使用`KMeans.train`方法训练模型,并指定聚类数为2,最大迭代次数为20。最后,我们输出聚类中心,并将模型保存到本地文件系统中。
如果想使用Spark MLlib中的KMeans算法实现聚类,可以使用以下代码:
```scala
import org.apache.spark.{SparkConf, SparkContext}
import org.apache.spark.ml.clustering.KMeans
import org.apache.spark.ml.feature.VectorAssembler
import org.apache.spark.sql.SparkSession
object KMeansExample {
def main(args: Array[String]): Unit = {
val conf = new SparkConf().setAppName("KMeansExample").setMaster("local")
val sc = new SparkContext(conf)
val spark = SparkSession
.builder()
.appName("KMeansExample")
.getOrCreate()
// 读取数据
val data = spark.read.format("csv")
.option("header", "false")
.option("delimiter", "\t")
.option("inferSchema", "true")
.load("watermelon.txt")
.toDF("density", "sugarContent")
.cache()
// 将密度和含糖率拼接成一个特征向量
val assembler = new VectorAssembler()
.setInputCols(Array("density", "sugarContent"))
.setOutputCol("features")
val assembledData = assembler.transform(data).cache()
// 聚类数为2,最大迭代次数为20
val kmeans = new KMeans().setK(2).setMaxIter(20)
// 训练模型
val model = kmeans.fit(assembledData)
// 输出聚类结果
println("Cluster centers:")
model.clusterCenters.foreach(println)
// 保存模型
model.write.overwrite().save("myModelPath")
// 加载模型
val sameModel = KMeansModel.load("myModelPath")
sc.stop()
}
}
```
上述代码首先使用Spark SQL中的`read`方法读取watermelon.txt文件中的数据,然后使用`VectorAssembler`将密度和含糖率拼接成一个特征向量。接着,我们使用`KMeans`类创建KMeans算法对象,并设置聚类数为2,最大迭代次数为20。最后,我们使用`fit`方法训练模型,并输出聚类中心。与使用Spark Core中的KMeans算法相比,使用Spark MLlib中的KMeans算法更方便,因为它可以直接读取DataFrame并进行转换。
西瓜数据集(watermelon.txt)各个特征的含义如下: 数据集的每一行由3个数值组成,前2个数字用\t分隔,后2个数字用空格分隔。 对于数据集文件watermelon.txt,请编写MapReduce程序,同时采用密度和含糖率数据作为特征,设类别数为2,利用 K-Means 聚类方法通过多次迭代对数据进行聚类。不使用第三方库,选取合适的Spark RDD转换算子和行动算子实现Kmeans算法,完成实验内容; 5. 基于Spark MLlib,实现Kmeans聚类计算,利用idea写出完整代码以及所需的pom文件
由于题目中要求使用MapReduce程序实现K-Means算法,因此我们需要先将数据转换为key-value对的形式,以便于MapReduce程序的处理。我们可以将每个数据点看作是一个二维坐标系中的点,将其坐标作为key,将其所属的聚类中心作为value。具体实现如下:
1. 数据预处理
首先读取数据集文件watermelon.txt,将其中的每一行解析为一个二维坐标和所属聚类中心的编号。对于每个聚类中心,我们可以随机指定一个初始坐标,将其作为第一次迭代的聚类中心。
```python
# 读取数据集文件
data = sc.textFile("watermelon.txt")
# 解析每个数据点
parsed_data = data.map(lambda line: tuple(map(float, line.split())))
# 随机初始化聚类中心
k = 2
centers = parsed_data.takeSample(False, k, 1)
```
2. K-Means算法迭代
接下来,我们可以使用MapReduce程序实现K-Means算法的迭代过程。在每次迭代中,我们需要对数据集中的每个点计算其与各个聚类中心的距离,并将其分配到距离最近的聚类中心所属的聚类中。然后,我们需要重新计算每个聚类中心的坐标,将其调整为该聚类中所有点的平均值。这样就完成了一次迭代,我们可以将新的聚类中心用于下一次迭代。
```python
# 迭代次数
iterations = 10
for i in range(iterations):
# 计算每个点与各个聚类中心的距离,将其分配到距离最近的聚类中心所属的聚类中
cluster_assignment = parsed_data.map(lambda point: (closest_center(point, centers), point))
# 计算新的聚类中心
new_centers = cluster_assignment.groupByKey().mapValues(lambda points: average_points(points)).collect()
# 更新聚类中心
for center in new_centers:
centers[center[0]] = center[1]
```
其中,closest_center函数用于计算每个点距离最近的聚类中心的编号,average_points函数用于计算一组点的平均值。
```python
def closest_center(point, centers):
"""返回距离最近的聚类中心的编号"""
closest_center = 0
closest_distance = float('inf')
for i in range(len(centers)):
distance = euclidean_distance(point, centers[i])
if distance < closest_distance:
closest_distance = distance
closest_center = i
return closest_center
def average_points(points):
"""计算一组点的平均值"""
num_points = len(points)
if num_points == 0:
return [0.0, 0.0]
x = sum([point[0] for point in points]) / num_points
y = sum([point[1] for point in points]) / num_points
return [x, y]
def euclidean_distance(p1, p2):
"""计算两个点之间的欧几里得距离"""
return ((p1[0] - p2[0]) ** 2 + (p1[1] - p2[1]) ** 2) ** 0.5
```
3. 结果输出
最后,我们可以将聚类结果输出到文件中,以便于后续的分析和可视化。
```python
# 将聚类结果输出到文件中
cluster_assignment.map(lambda pair: f"{pair[1][0]}\t{pair[1][1]}\t{pair[0]}").saveAsTextFile("output")
```
完整代码如下:
```python
from pyspark import SparkContext
# 初始化SparkContext
sc = SparkContext()
# 解析数据集文件
data = sc.textFile("watermelon.txt")
parsed_data = data.map(lambda line: tuple(map(float, line.split())))
# 随机初始化聚类中心
k = 2
centers = parsed_data.takeSample(False, k, 1)
# 迭代次数
iterations = 10
for i in range(iterations):
# 计算每个点与各个聚类中心的距离,将其分配到距离最近的聚类中心所属的聚类中
cluster_assignment = parsed_data.map(lambda point: (closest_center(point, centers), point))
# 计算新的聚类中心
new_centers = cluster_assignment.groupByKey().mapValues(lambda points: average_points(points)).collect()
# 更新聚类中心
for center in new_centers:
centers[center[0]] = center[1]
# 将聚类结果输出到文件中
cluster_assignment.map(lambda pair: f"{pair[1][0]}\t{pair[1][1]}\t{pair[0]}").saveAsTextFile("output")
def closest_center(point, centers):
"""返回距离最近的聚类中心的编号"""
closest_center = 0
closest_distance = float('inf')
for i in range(len(centers)):
distance = euclidean_distance(point, centers[i])
if distance < closest_distance:
closest_distance = distance
closest_center = i
return closest_center
def average_points(points):
"""计算一组点的平均值"""
num_points = len(points)
if num_points == 0:
return [0.0, 0.0]
x = sum([point[0] for point in points]) / num_points
y = sum([point[1] for point in points]) / num_points
return [x, y]
def euclidean_distance(p1, p2):
"""计算两个点之间的欧几里得距离"""
return ((p1[0] - p2[0]) ** 2 + (p1[1] - p2[1]) ** 2) ** 0.5
```
这里仅提供了使用MapReduce程序实现K-Means算法的实现方式,如果需要使用Spark MLlib进行K-Means聚类计算,可以参考以下代码:
```python
from pyspark.ml.clustering import KMeans
from pyspark.sql import SparkSession
# 初始化SparkSession
spark = SparkSession.builder.appName("KMeans").getOrCreate()
# 读取数据集文件
data = spark.read.format("libsvm").load("watermelon.txt")
# 训练K-Means模型
kmeans = KMeans(k=2, seed=1)
model = kmeans.fit(data)
# 输出聚类结果
print("Cluster Centers:")
centers = model.clusterCenters()
for center in centers:
print(center)
```
其中,libsvm格式的数据集文件是指每行数据的格式为"标签 特征1:值1 特征2:值2 ...",在这里我们可以将标签设为0,将密度和含糖率作为两个特征。在输出聚类结果时,我们可以通过model.clusterCenters()获取聚类中心的坐标,从而进行后续分析和可视化。
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