帮我写一个能够检测vasp任务并且提取任务的python程序

时间: 2023-06-04 11:05:56 浏览: 262
好的,关于您的问题,我可以为您提供帮助。以下是一个能够检测 vaspt 任务并且提取任务的 Python 程序代码: ``` import os def check_vasp_task(): # 查看当前目录中是否有 vasprun.xml 文件,如果有则说明有任务正在运行 if "vasprun.xml" in os.listdir(): return True else: return False def extract_vasp_task(): if check_vasp_task(): # 任务正在运行,则提取任务 task = "vasp" return task else: return None ``` 您可以将此代码添加到您的 Python 程序中,调用 check_vasp_task() 函数来检测是否有任务正在运行并调用 extract_vasp_task() 函数来提取任务。此程序将仅检测运行 vaspt 任务,并提取该任务。如果您有其他需求,请告知我。
相关问题

写一个linux系统排队执行vasp计算任务的shell脚本

以下是一个简单的Linux系统排队执行VASP计算任务的Shell脚本: ```bash #!/bin/bash # 定义VASP计算程序路径和输入文件名 VASP_PATH=/path/to/vasp INPUT_FILE=INCAR # 定义任务目录和任务列表文件名 TASK_DIR=/path/to/tasks TASK_LIST=tasks.txt # 定义并创建结果目录 RESULT_DIR=/path/to/results mkdir -p $RESULT_DIR # 循环处理任务列表中的任务 while read -r task; do # 进入任务目录 cd $TASK_DIR/$task # 判断是否存在输入文件 if [ ! -f $INPUT_FILE ]; then echo "Error: $INPUT_FILE not found in $TASK_DIR/$task" continue fi # 判断是否已经执行过该任务 if [ -f $RESULT_DIR/$task.out ]; then echo "Warning: $task already executed, skipping" continue fi # 执行VASP计算程序 echo "Starting calculation for $task" $VASP_PATH > $RESULT_DIR/$task.out # 判断计算是否成功 if [ $? -eq 0 ]; then echo "Calculation for $task successful" else echo "Error: Calculation for $task failed" fi done < $TASK_LIST ``` 以上Shell脚本首先定义了VASP计算程序路径和输入文件名,然后定义任务目录和任务列表文件名,以及结果目录。接下来,它循环遍历任务列表中的任务,并进入任务目录进行计算。在计算之前,它会检查输入文件是否存在,并且检查结果目录中是否已经存在该任务的输出文件。如果计算成功,它将输出"Calculation for $task successful",否则输出"Error: Calculation for $task failed"。最终,它将任务的输出保存到结果目录中。

写一个linux系统排队执行vasp计算任务的shell脚本,并解释每一行

以下一个简单的Linux系统排队执行VASP计算任务的shell脚本,以及每一行的解释: ```bash #!/bin/bash #PBS -l nodes=1:ppn=8 #PBS -l walltime=10:00:00 #PBS -N VASP_calculation #PBS -q batch cd $PBS_O_WORKDIR for dir in $(ls -d */) do if [ -f $dir/INCAR ] && [ -f $dir/KPOINTS ] && [ -f $dir/POTCAR ] then cd $dir mpirun -np 8 vasp > vasp.log cd .. fi done ``` 1. `#!/bin/bash`:指定脚本使用的shell为bash。 2. `#PBS -l nodes=1:ppn=8`:指定使用1个节点,每个节点上有8个处理器。 3. `#PBS -l walltime=10:00:00`:指定任务最长运行时间为10小时。 4. `#PBS -N VASP_calculation`:指定任务名称为“VASP_calculation”。 5. `#PBS -q batch`:指定任务提交到“batch”队列。 6. `cd $PBS_O_WORKDIR`:切换到PBS工作目录。 7. `for dir in $(ls -d */)`:遍历当前目录下的所有子目录。 8. `if [ -f $dir/INCAR ] && [ -f $dir/KPOINTS ] && [ -f $dir/POTCAR ] ]`:判断子目录中是否包含INCAR、KPOINTS和POTCAR文件。 9. `cd $dir`:切换到子目录。 10. `mpirun -np 8 vasp > vasp.log`:使用8个处理器运行VASP,并将输出重定向到vasp.log文件中。 11. `cd ..`:返回到父目录。

相关推荐

最新推荐

recommend-type

VASP5.4.4 GPU编译安装流程.docx

nvidia GPU 环境下安装vasp5.4.4 GPU编译 花了2天的时间 针对GPU版本的vasp5.4.4进行编译,还是挺折腾人的!!!!!!!!
recommend-type

VASP输入文件笔记.docx

VASP输入文件个人笔记小结。包括INCAR、POSCAR、POTCAR、KPOINTS四个关键文件如何设置,参数含义,以及设置的物理化学意义。
recommend-type

VASP-5.4.1 编译

此文档包含了vasp 5.4.1编译,还包含了VTST编译,轻松上手CI-NEB.
recommend-type

RTL8188FU-Linux-v5.7.4.2-36687.20200602.tar(20765).gz

REALTEK 8188FTV 8188eus 8188etv linux驱动程序稳定版本, 支持AP,STA 以及AP+STA 共存模式。 稳定支持linux4.0以上内核。
recommend-type

管理建模和仿真的文件

管理Boualem Benatallah引用此版本:布阿利姆·贝纳塔拉。管理建模和仿真。约瑟夫-傅立叶大学-格勒诺布尔第一大学,1996年。法语。NNT:电话:00345357HAL ID:电话:00345357https://theses.hal.science/tel-003453572008年12月9日提交HAL是一个多学科的开放存取档案馆,用于存放和传播科学研究论文,无论它们是否被公开。论文可以来自法国或国外的教学和研究机构,也可以来自公共或私人研究中心。L’archive ouverte pluridisciplinaire
recommend-type

:YOLO目标检测算法的挑战与机遇:数据质量、计算资源与算法优化,探索未来发展方向

![:YOLO目标检测算法的挑战与机遇:数据质量、计算资源与算法优化,探索未来发展方向](https://img-blog.csdnimg.cn/7e3d12895feb4651b9748135c91e0f1a.png?x-oss-process=image/watermark,type_ZHJvaWRzYW5zZmFsbGJhY2s,shadow_50,text_Q1NETiBA5rKJ6YaJ77yM5LqO6aOO5Lit,size_20,color_FFFFFF,t_70,g_se,x_16) # 1. YOLO目标检测算法简介 YOLO(You Only Look Once)是一种
recommend-type

def ObjFun(x,y,beta): # 目标函数 """ Logistic regression loss function :param beta: model parameter vector :param x: feature matrix :param y: label vector :return: loss value """ n = x.shape[0] p = x.shape[1] pred = 1 / (1 + np.exp(-np.dot(x, beta))) pred = np.clip(pred, 1e-15, 1 - 1e-15) # 将预测值限制在一个很小的区间内 ObjVal = -np.sum(y * np.log(pred) + (1 - y) * np.log(1 - pred)) / n return ObjVal

好的,根据上面的目标函数,我们可以推导出其对应的梯度向量函数,如下所示: def gradient(x, y, beta): """ Compute gradient of the logistic regression loss function :param beta: model parameter vector :param x: feature matrix :param y: label vector :return: gradient vector """ n = x.shape[0] pred = 1 /
recommend-type

c++校园超市商品信息管理系统课程设计说明书(含源代码) (2).pdf

校园超市商品信息管理系统课程设计旨在帮助学生深入理解程序设计的基础知识,同时锻炼他们的实际操作能力。通过设计和实现一个校园超市商品信息管理系统,学生掌握了如何利用计算机科学与技术知识解决实际问题的能力。在课程设计过程中,学生需要对超市商品和销售员的关系进行有效管理,使系统功能更全面、实用,从而提高用户体验和便利性。 学生在课程设计过程中展现了积极的学习态度和纪律,没有缺勤情况,演示过程流畅且作品具有很强的使用价值。设计报告完整详细,展现了对问题的深入思考和解决能力。在答辩环节中,学生能够自信地回答问题,展示出扎实的专业知识和逻辑思维能力。教师对学生的表现予以肯定,认为学生在课程设计中表现出色,值得称赞。 整个课程设计过程包括平时成绩、报告成绩和演示与答辩成绩三个部分,其中平时表现占比20%,报告成绩占比40%,演示与答辩成绩占比40%。通过这三个部分的综合评定,最终为学生总成绩提供参考。总评分以百分制计算,全面评估学生在课程设计中的各项表现,最终为学生提供综合评价和反馈意见。 通过校园超市商品信息管理系统课程设计,学生不仅提升了对程序设计基础知识的理解与应用能力,同时也增强了团队协作和沟通能力。这一过程旨在培养学生综合运用技术解决问题的能力,为其未来的专业发展打下坚实基础。学生在进行校园超市商品信息管理系统课程设计过程中,不仅获得了理论知识的提升,同时也锻炼了实践能力和创新思维,为其未来的职业发展奠定了坚实基础。 校园超市商品信息管理系统课程设计的目的在于促进学生对程序设计基础知识的深入理解与掌握,同时培养学生解决实际问题的能力。通过对系统功能和用户需求的全面考量,学生设计了一个实用、高效的校园超市商品信息管理系统,为用户提供了更便捷、更高效的管理和使用体验。 综上所述,校园超市商品信息管理系统课程设计是一项旨在提升学生综合能力和实践技能的重要教学活动。通过此次设计,学生不仅深化了对程序设计基础知识的理解,还培养了解决实际问题的能力和团队合作精神。这一过程将为学生未来的专业发展提供坚实基础,使其在实际工作中能够胜任更多挑战。
recommend-type

"互动学习:行动中的多样性与论文攻读经历"

多样性她- 事实上SCI NCES你的时间表ECOLEDO C Tora SC和NCESPOUR l’Ingén学习互动,互动学习以行动为中心的强化学习学会互动,互动学习,以行动为中心的强化学习计算机科学博士论文于2021年9月28日在Villeneuve d'Asq公开支持马修·瑟林评审团主席法布里斯·勒菲弗尔阿维尼翁大学教授论文指导奥利维尔·皮耶昆谷歌研究教授:智囊团论文联合主任菲利普·普雷教授,大学。里尔/CRISTAL/因里亚报告员奥利维耶·西格德索邦大学报告员卢多维奇·德诺耶教授,Facebook /索邦大学审查员越南圣迈IMT Atlantic高级讲师邀请弗洛里安·斯特鲁布博士,Deepmind对于那些及时看到自己错误的人...3谢谢你首先,我要感谢我的两位博士生导师Olivier和Philippe。奥利维尔,"站在巨人的肩膀上"这句话对你来说完全有意义了。从科学上讲,你知道在这篇论文的(许多)错误中,你是我可以依
recommend-type

:YOLO目标检测算法的最佳实践:模型训练、超参数调优与部署优化,打造高性能目标检测系统

![:YOLO目标检测算法的最佳实践:模型训练、超参数调优与部署优化,打造高性能目标检测系统](https://img-blog.csdnimg.cn/20201024153508415.png?x-oss-process=image/watermark,type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk,shadow_10,text_aHR0cHM6Ly9ibG9nLmNzZG4ubmV0L1NNRjA1MDQ=,size_16,color_FFFFFF,t_70) # 1. YOLO目标检测算法概述 **1.1 YOLO算法简介** YOLO(You Only Look Once)是一种