python 修改nii.gz格式图像分辨率

要修改nii.gz格式图像分辨率可以使用Python中的nibabel库。首先需要安装nibabel库，可以使用以下命令进行安装：

pip install nibabel

然后可以使用以下代码将原始图像读取为nibabel格式对象：

import nibabel as nib

img = nib.load('original_image.nii.gz')

接着可以使用相应的方法修改分辨率，例如将分辨率修改为1x1x1：

new_zooms = (1, 1, 1)
new_affine = img.affine.copy()
new_affine[0:3,0:3] = img.affine[0:3,0:3]*img.header.get_zooms()[:3]/new_zooms
new_img = nib.Nifti1Image(img.get_fdata(), new_affine)

最后将修改后的图像保存：

nib.save(new_img, 'modified_image.nii.gz')

相关问题

python 批量修改nii.gz格式图像分辨率

可以使用 SimpleITK 库来批量修改 nii.gz 格式图像的分辨率。以下是一个示例代码：

import SimpleITK as sitk
import os

input_dir = "/path/to/input/dir"
output_dir = "/path/to/output/dir"
new_spacing = (1.0, 1.0, 1.0)  # 新的分辨率

for filename in os.listdir(input_dir):
    if filename.endswith(".nii.gz"):
        input_path = os.path.join(input_dir, filename)
        output_path = os.path.join(output_dir, filename)
        image = sitk.ReadImage(input_path)
        old_spacing = image.GetSpacing()
        new_size = [int(round(old_size * old_spacing / new_spacing)) for old_size in image.GetSize()]
        resample = sitk.ResampleImageFilter()
        resample.SetOutputSpacing(new_spacing)
        resample.SetSize(new_size)
        resample.SetOutputDirection(image.GetDirection())
        resample.SetOutputOrigin(image.GetOrigin())
        resample.SetTransform(sitk.Transform())
        resample.SetInterpolator(sitk.sitkLinear)
        resampled_image = resample.Execute(image)
        sitk.WriteImage(resampled_image, output_path)

这个代码会将 `input_dir` 目录下所有的 `.nii.gz` 文件的分辨率修改为 `(1.0, 1.0, 1.0)`，并保存到 `output_dir` 目录下。

如何用python批量调整.nii.gz格式的分辨率

你可以使用 SimpleITK 库来批量调整.nii.gz格式的分辨率。以下是一个示例代码：

import SimpleITK as sitk
import os

# 设置输入和输出文件夹路径
input_folder = "input_folder_path"
output_folder = "output_folder_path"

# 获取输入文件夹中所有.nii.gz文件的路径
input_files = [os.path.join(input_folder, f) for f in os.listdir(input_folder) if f.endswith(".nii.gz")]

# 循环遍历每个输入文件，调整分辨率并保存到输出文件夹中
for input_file in input_files:
    # 读取输入文件
    image = sitk.ReadImage(input_file)

    # 设置新的分辨率
    new_spacing = [1.0, 1.0, 1.0]  # 这里设置为1.0，你可以根据需要修改

    # 调整分辨率
    original_spacing = image.GetSpacing()
    original_size = image.GetSize()
    new_size = [int(round(original_size[0] * (original_spacing[0] / new_spacing[0]))),
                int(round(original_size[1] * (original_spacing[1] / new_spacing[1]))),
                int(round(original_size[2] * (original_spacing[2] / new_spacing[2])))]
    new_image = sitk.Resample(image, new_size, sitk.Transform(), sitk.sitkLinear, image.GetOrigin(),
                              new_spacing, image.GetDirection(), 0.0, image.GetPixelID())

    # 保存输出文件
    output_file = os.path.join(output_folder, os.path.basename(input_file))
    sitk.WriteImage(new_image, output_file)

这个代码将读取输入文件夹中所有.nii.gz文件，将它们的分辨率调整为1.0，并保存到输出文件夹中。你可以根据需要修改分辨率的值。