MDS算法matlab代码
时间: 2023-09-14 18:04:58 浏览: 155
以下是MDS算法的Matlab代码示例:
假设我们有一个距离矩阵D,我们希望将其转换为一个低维空间中的点集X:
```matlab
% 距离矩阵D
D = [...];
% 计算D的平方
D2 = D.^2;
% 计算D2的列平均值
meanD2 = mean(D2,2);
% 计算D2的行平均值
meanD2_all = mean(meanD2);
% 计算B矩阵
B = -(D2 - meanD2*ones(1,size(D2,2)) - ones(size(D2,1),1)*meanD2_all + meanD2_all);
% 对B进行特征分解
[V,~] = eig(B);
% 提取V的前d列
d = 2; % 低维空间的维数
X = V(:,1:d);
```
在这个例子中,我们先将距离矩阵D转换为距离矩阵的平方D2,然后计算B矩阵。接下来,我们使用特征分解来得到B矩阵的特征向量,然后选择前d个特征向量并将它们作为低维空间中的点集X。请注意,这只是一个简单的示例,实际实现中可能需要进行更多的处理和调整。
相关问题
黎曼MDS降维算法MATLAB代码
以下是黎曼MDS降维算法的MATLAB代码,仅供参考:
```
function [Y, eigvalue] = RiemannMDS(X, d)
% X: input SPD matrices in the cell format (N x 1), N is the number of matrices
% d: the number of dimensions for the embedding space
% Y: output low-dimensional embedding vectors (N x d)
% eigvalue: the eigenvalues of the covariance matrix
N = length(X);
P = zeros(N, N);
for i = 1:N
for j = 1:N
P(i,j) = log(det(X{i} + X{j})) - 0.5 * (log(det(X{i})) + log(det(X{j})));
end
end
P = -0.5 * P;
H = eye(N) - ones(N, N)/N;
B = H * P * H;
[V, D] = eig(B);
[~, index] = sort(diag(D), 'descend');
Y = V(:, index(1:d)) * sqrt(D(index(1:d), index(1:d)));
eigvalue = diag(D);
end
```
该代码实现了Riemannian MDS算法,对输入的SPD矩阵进行降维。具体实现过程为:计算输入矩阵的黎曼距离矩阵,将其转化为半正定矩阵,并进行特征值分解,选取前d个特征值对应的特征向量作为输出矩阵的降维结果。
MDS降维算法matlab
在 MATLAB 中,可以使用以下命令来实现 MDS(多维缩放)算法进行降维:
1. 读取数据
```
data = importdata('data.txt'); % 读取数据
```
2. 计算相似度矩阵
```
D = pdist(data); % 计算距离矩阵
S = squareform(D); % 转换成相似度矩阵
```
3. 计算 MDS
```
[Y, eigvals] = cmdscale(S); % 计算 MDS
```
其中,Y 是降维后的数据矩阵,eigvals 是特征值。
完整的 MDS 降维代码如下:
```
data = importdata('data.txt'); % 读取数据
D = pdist(data); % 计算距离矩阵
S = squareform(D); % 转换成相似度矩阵
[Y, eigvals] = cmdscale(S); % 计算 MDS
```
其中,'data.txt' 是数据文件名,需要根据实际情况进行修改。
阅读全文
相关推荐















