R语言 进化树末端连接

在R语言中，可以使用包treeio来读取和处理各种系统发育树文件格式。例如，可以使用read.tree函数从Newick格式、read.nexus函数从Nexus格式、以及read.phylo函数从Phylip格式读取系统发育树数据。另外，在数学中，树是一种特殊的无向图，它没有任何循环，并且任意两个顶点之间都只有一条简单路径。树在计算机科学中被广泛应用，比如表示文件系统、程序的调用关系、HTML文档的DOM结构等。为了连接进化树的末端，可以使用ggtree包中的函数和方法。例如，可以使用tree_subset函数来取树的子集，通过指定节点和层数来选择感兴趣的子树。然后，可以使用ggtree函数和相应的geom_tiplab函数来绘制进化树的末端，并使用xlim函数来设置x轴的范围。此外，可以使用scale_color_manual函数来设置末端连接的颜色。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span>
#### 引用[.reference_title]
- *1* *2* *3* [R绘制优美的进化树（基础）](https://blog.csdn.net/Asa12138/article/details/130537612)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 100%"]
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