freesurfer安装教程

Freesurfer是一款用于处理和分析脑成像数据的软件，目前只支持安装在Linux系统上。以下是Freesurfer的安装教程：
1. 将Freesurfer压缩包放在指定目录下，例如/home/tj/application/。
2. 运行命令解压压缩包：sudo tar -zxvf freesurfer安装包文件名。
3. 改变Freesurfer的文件权限：sudo chmod -R 777 ./freesurfer。
4. 配置全局环境变量：sudo gedit /etc/profile，添加以下内容：export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer。
5. 配置当前用户环境变量：sudo gedit /etc/bash.bashrc，添加以下内容：export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer，source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh。
6. 将注册的license文件复制到/application/freesurfer/目录下：sudo cp /home/tj/application/license.txt /home/tj/application/freesurfer。
7. 验证安装是否成功，输入如下指令：tkregister2、tkmedit、tksurfer和recon-all --help，如果没有报错则说明基本安装成功了。
8. 如果需要进行数据处理和分析，可以参考Freesurfer配准步骤，例如使用mri_surf2surf命令进行配准。