counts fpkm 转换

FPKM（Reads Per Kilobase per Million）是一种基因表达水平的度量单位，它校正了测序深度和基因长度的影响，用于比较不同基因或样本之间的表达差异。将counts转换为FPKM的过程如下：

首先，需要计算每个基因的长度（L），可以根据基因组注释文件获取。接下来，需要计算总的测序深度（N），即所测得的总reads数。然后，对每个基因的reads的数量（counts）进行修正，除以该基因的长度（L）和总测序深度（N），得到每个基因的FPKM值。

具体计算公式如下：

FPKM = (counts / L) / (N / 10^6)

其中，counts表示某个基因的reads数量，L表示该基因的长度，N表示总的测序深度。最后，乘以10^6是为了将FPKM的值进行标准化，使之可以进行比较。

另外，需要注意counts的来源，可以是基因的read数，也可以是基因对应的reads覆盖度，根据具体情况选择合适的count值进行转换。

总结来说，counts fpkm转换即通过校正基因长度和总测序深度的影响，将基因的reads数量转化为FPKM值，以便进行基因表达水平的比较分析。