for (i in seq_along(k_values)) { k <- k_values[i] clusters <- cutree(hclust_result, k = k) #ch_scores[i] <- calinski_harabasz(datExpr0, clusters) # 计算Calinski-Harabasz指标 ch_score <- cluster.stats(dist_matrix, clustering)["ch"] }报错Error in max(clustering) : invalid 'type' (list) of argument如何修改
时间: 2024-04-17 19:25:06 浏览: 65
在你的代码中,出现了一个错误。错误信息 "invalid 'type' (list) of argument" 是因为你将一个列表 `clustering` 传递给了 `max` 函数,而 `max` 函数期望接收一个向量作为参数。
要解决这个问题,你需要将 `clustering` 转换为向量形式。根据你的代码,我假设 `clustering` 是一个列表,其中每个元素表示一个分类结果。你可以使用 `unlist` 函数将其转换为向量。以下是修改后的代码:
```R
ch_scores <- numeric(length(k_values))
for (i in seq_along(k_values)) {
k <- k_values[i]
clusters <- cutree(hclust_result, k = k)
ch_score <- cluster.stats(dist_matrix, clusters)["ch"]
ch_scores[i] <- ch_score
}
```
在上述代码中,我们使用 `cutree` 函数根据给定的k值将层次聚类结果划分为不同的簇。然后,我们使用 `cluster.stats` 函数计算每个k值下的Calinski-Harabasz指标,并将其赋值给 `ch_score` 变量。最后,我们将 `ch_score` 添加到 `ch_scores` 向量中。
请注意,这里假设你的 `cluster.stats` 函数可以接受簇标签(clusters)的向量形式作为参数。如果你使用的是不同的包或函数,可能需要稍作修改以符合相应的函数接口。
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