我的代码里没有R软件显示报错的这串代码怎么回事 Error in `[<-`(`*tmp*`, i, , value = c(row, col)) : subscript out of bounds

这个错误通常表示您尝试访问数组或矩阵中不存在的元素。可能是由于以下原因之一导致的：

1. 索引超出了数组或矩阵的范围。请注意，数组和矩阵的索引从1开始而不是从0开始。

2. 数组或矩阵不是您预期的大小。在尝试分配新值之前，请确保您的数组或矩阵已经被正确初始化。

3. 您的代码中存在其他错误，导致该错误。请检查您的代码并尝试逐步调试它。

如果您能提供更多的上下文或代码示例，我可以更准确地帮助您。

相关问题

显示报错我怎么定位报错的地方，例如 Error in [<-(*tmp*, i, , value = c(row, col)) : subscript out of bounds

当您在 R 语言中遇到错误时，可以根据错误信息中提供的信息来定位错误的位置。通常情况下，错误信息会告诉您哪一行代码引发了错误，具体的错误类型以及错误的原因。

对于您提到的 `subscript out of bounds` 错误，错误信息中通常会指出出错的函数和变量，例如 `[<-(*tmp*, i, , value = c(row, col))`。您可以根据这个信息来找到出错的函数和变量。通常可以通过使用 `traceback()` 函数来查看函数调用堆栈，以确定错误的来源。

例如，如果您运行以下代码：

my_matrix <- matrix(1:9, nrow = 3)
my_matrix[4, 2] <- 0

将会得到以下错误信息：

Error in `[<-`(`*tmp*`, 4, 2, value = 0) : 
  subscript out of bounds

这个错误信息告诉我们，错误出现在第二行代码中，因为它尝试访问矩阵中不存在的元素 `[4, 2]`。在这种情况下，我们可以使用 `traceback()` 函数来查看函数调用堆栈，以确定错误的来源：

my_matrix <- matrix(1:9, nrow = 3)
traceback()
my_matrix[4, 2] <- 0

这将会输出以下信息：

> traceback()
4: stop("subscript out of bounds")
3: `[<-`(`*tmp*`, 4, 2, value = 0)
2: eval(expr, envir, enclos)
1: eval(ei, envir)

从输出信息中，我们可以看到错误发生在 `[<-` 函数中，这个函数是由 R 自动调用的，用于修改矩阵的值。因此，我们可以确定错误的来源是尝试访问矩阵中不存在的元素。

dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = counts, colData = NULL, design = ~ 1) Error in rownames<-(*tmp*, value = colnames(countData)) : 不能给没有维度的对象设'rownames'

这个错误通常是由于`countData`矩阵没有列名导致的。在使用`DESeqDataSetFromMatrix`函数时，它需要从`countData`矩阵中获取基因名作为行名，获取样本名作为列名，如果`countData`矩阵没有列名，则会出现上述错误。

解决办法是在读取`counts`矩阵时，将`header`参数设置为`TRUE`，以读取列名。例如：

counts <- read.table("counts.txt", header=TRUE, row.names=1)

如果`counts`矩阵已经读取，但是没有列名，可以使用以下代码给`counts`矩阵添加列名：

colnames(counts) <- c("Sample1", "Sample2", "Sample3", ...) # 替换成实际的样本名

然后再将`counts`矩阵作为参数传递给`DESeqDataSetFromMatrix`函数即可。