pymatgen将json文件转化为多个cif文件的代码
时间: 2024-03-14 08:45:19 浏览: 260
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以下是使用Pymatgen将包含多个晶体结构数据的json文件转化为多个cif文件的示例代码:
```python
from pymatgen.io.cif import CifWriter
from pymatgen import Structure
import json
# 读取json文件
with open('example.json', 'r') as f:
data = json.load(f)
# 遍历json文件中的晶体结构数据
for i, entry in enumerate(data):
# 构建pymatgen Structure对象
structure = Structure.from_dict(entry['structure'])
# 写入cif文件
writer = CifWriter(structure)
writer.write_file(f'example_{i}.cif')
```
这段代码首先使用`json`库读取`example.json`文件,然后遍历其中的晶体结构数据,并使用`pymatgen`的`Structure.from_dict()`方法将json格式的数据转化为`Structure`对象。最后,使用`CifWriter`将每个`Structure`对象写入单独的cif文件中,文件名按照`example_{i}.cif`的格式命名,其中`{i}`表示晶体结构在json文件中的序号。需要注意的是,如果json文件中的数据格式不符合pymatgen的要求,转化过程可能会出现错误。
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