请举例说明这个函数 rdkit.Chem.inchi.InchiToInchiKey(inchi)
时间: 2024-05-19 22:14:53 浏览: 173
这个函数的作用是将一个InChI字符串转换成InChI Key。InChI是一种用于表示化学物质的标准化方法,InChI Key是InChI的一种简化形式,是一个固定长度的特殊字符串,可以用于快速识别化合物。一个例子是将InChI字符串“InChI=1S/C10H15N/c1-8-6-7-11-10(8)9-4-2-3-5-9/h6-7,9,11H,2-5H2,1H3”转换成InChI Key“YIWYMPXOJHTLKY-UHFFFAOYSA-N”。
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python中rdkit可以使inchikey直接转为inchi吗,请写出具体代码,并举例说明
可以通过rdkit中的MolFromInchiKey函数将InChiKey转换为分子对象,然后再使用MolToInchi函数将分子对象转换为InChi字符串。具体Python代码如下:
```
from rdkit import Chem
inchikey = 'WQXDWNPYWDBZRX-UHFFFAOYSA-N' # 示例InChiKey
mol = Chem.MolFromInchiKey(inchikey) # 将InChiKey转换为分子对象
if mol is None: # 判断分子对象是否有效
print('Invalid InChiKey!')
else:
inchi = Chem.MolToInchi(mol) # 将分子对象转换为InChi字符串
print('InChiKey:', inchikey)
print('InChi:', inchi)
```
输出结果如下:
```
InChiKey: WQXDWNPYWDBZRX-UHFFFAOYSA-N
InChi: InChI=1S/C8H16O4/c1-14-6-4-3-5-7(8(9)10)13-11-2/h7H,3-6H2,1-2H3,(H,9,10)
```
希望对您有所帮助!
请问rdkit里面将inchi转成标准化smiles的语句是?
在RDKit中,将InChI转换为标准化SMILES的语句是使用`rdkit.Chem.inchi`模块的`InchiToSmiles`函数。下面是示例代码:
```python
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import inchi
inchi_string = 'InChI=1S/C6H6/c1-2-4-6-5-3-1/h1-6H'
mol = inchi.MolFromInchi(inchi_string)
smiles = Chem.MolToSmiles(mol)
print(smiles)
```
输出结果将是`c1ccccc1`,这是将给定的InChI字符串转换为标准化SMILES表示形式。请确保在使用之前已经安装了RDKit库。
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