用c++写一个cpk计算代码
时间: 2024-05-29 18:08:43 浏览: 197
好的,下面是使用 C 语言编写的计算 CPK 值的代码:
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
int main() {
char* seq = "AAACCCGGGTTT";
int aa_count[26] = {0}; // 统计每种氨基酸的数量
// 统计氨基酸数量
for (int i = 0; i < strlen(seq); i++) {
aa_count[seq[i] - 'A']++;
}
// 计算 CPK 值
double sum = 0;
for (int i = 0; i < 26; i++) {
int count = aa_count[i];
double freq = (double)count / strlen(seq);
double pka = 0;
// 根据不同的氨基酸计算对应的 pka 值
switch (i) {
case 0: pka = 1.0; break;
case 2: pka = 10.8; break;
case 3: pka = 10.8; break;
case 6: pka = 6.5; break;
case 8: pka = 5.5; break;
case 11: pka = 12.5; break;
case 12: pka = 10.4; break;
case 13: pka = 3.9; break;
case 16: pka = 4.5; break;
case 18: pka = 3.9; break;
case 19: pka = 4.2; break;
case 20: pka = 6.0; break;
default: pka = 0; break;
}
double pkx = 9.6; // 默认的 pkx 值为 9.6
double delta_pka = pkx - pka;
double delta_pkb = -1.0 * delta_pka;
double cpk = freq * (1 + pow(10, delta_pka) + pow(10, delta_pkb));
sum += cpk;
}
printf("CPK 值为:%f\n", sum);
return 0;
}
这段代码可以计算给定的氨基酸序列 seq 的 CPK 值。具体的计算方法请参考相关资料。
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