应用Horspool算法在文本“TTATAGATCTCGTATTCTTTTATAGATCTCCTATTCTT”中查找模式“TCCTATTCTT”要求计算出移动距离表。
时间: 2024-03-31 07:36:19 浏览: 45
好的,根据您的要求,我来回答您的问题。
首先,我们需要对模式字符串进行预处理,生成移动距离表。Horspool算法的移动距离表是一个长度为256的数组,每个元素表示该字符最后一次出现在模式字符串中的位置距离模式字符串末尾的距离。
对于本题中的模式字符串"TCCTATTCTT",其移动距离表如下所示:
| 字符 | T | C | A | G |
| ---- | - | - | - | - |
| 移动距离 | 9 | 1 | 10 | 10 |
接下来,我们可以使用移动距离表进行匹配。具体过程如下:
1. 将模式字符串与文本字符串对齐,从模式字符串的末尾开始比较。
2. 如果当前字符匹配成功,则继续比较前一个字符,直到模式字符串的第一个字符。
3. 如果比较失败,则根据移动距离表计算移动距离,将模式字符串向右移动相应的距离。
4. 如果移动距离超出文本字符串的长度,则匹配失败。
根据上述过程,我们可以在文本"TTATAGATCTCGTATTCTTTTATAGATCTCCTATTCTT"中找到模式"TCCTATTCTT"。具体步骤如下所示:
1. 将模式字符串"TCCTATTCTT"与文本字符串对齐,从模式字符串的末尾开始比较。
TTATAGATCTCGTATTCTTTTATAGATCTCCTATTCTT
TCCTATTCTT
2. 比较成功,继续比较前一个字符。
TTATAGATCTCGTATTCTTTTATAGATCTCCTATTCTT
TCCTATTCTT
3. 比较失败,根据移动距离表计算移动距离为1,将模式字符串向右移动1个字符。
TTATAGATCTCGTATTCTTTTATAGATCTCCTATTCTT
TCCTATTCTT
4. 比较成功,继续比较前一个字符。
TTATAGATCTCGTATTCTTTTATAGATCTCCTATTCTT
TCCTATTCTT
5. 比较失败,根据移动距离表计算移动距离为8,将模式字符串向右移动8个字符。
TTATAGATCTCGTATTCTTTTATAGATCTCCTATTCTT
TCCTATTCTT
6. 比较成功,继续比较前一个字符。
TTATAGATCTCGTATTCTTTTATAGATCTCCTATTCTT
TCCTATTCTT
7. 比较成功,继续比较前一个字符。
TTATAGATCTCGTATTCTTTTATAGATCTCCTATTCTT
TCCTATTCTT
8. 匹配成功,返回匹配位置。
综上所述,模式字符串"TCCTATTCTT"在文本"TTATAGATCTCGTATTCTTTTATAGATCTCCTATTCTT"中的匹配位置为第23个字符。
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