r语言前两个主成分的累计贡献率
时间: 2023-09-27 13:05:33 浏览: 36
要获取前两个主成分的累计贡献率,可以按照以下步骤:
1. 运行prcomp()函数进行PCA:
```
pca <- prcomp(df, scale. = TRUE)
```
2. 运行summary()函数获取每个主成分的贡献率和累计贡献率:
```
summary(pca, cumulate = TRUE)
```
在输出结果中,可以看到每个主成分的标准偏差(Standard deviation)、贡献率(Proportion of Variance)和累计贡献率(Cumulative Proportion)。
3. 查看前两个主成分的累计贡献率:
```
summary(pca, cumulate = TRUE)$cumulative[2]
```
这将返回前两个主成分的累计贡献率。
相关问题
R语言实现对IRIS的主成分分析,对分析输出的所有变量做出解释,分别画出方差贡献率、累计方差贡献率、前两维特征对应的散点图和前三维特征的散点图
好的,这是一个关于R语言实现对IRIS数据集的主成分分析的问题。主成分分析(PCA)是一种非监督学习方法,用于解决高维数据分析的问题。下面是对输出变量的解释:
1. 方差贡献率:它衡量每个主成分对总方差的贡献程度。它代表着每个主成分所能解释的原始数据中方差的比例,因此越大,该主成分解释的贡献越重要。
2. 累计方差贡献率:它是前K个主成分的方差贡献率之和。它代表着在前K个主成分中所包含的原始数据中方差占总方差的比例。使用累计方差贡献率可以帮助我们判断前几个主成分是否足够解释数据的大部分变化。
3. 前两维特征对应的散点图和前三维特征的散点图:它们是用来描述主成分之间的相关性以及在低维空间中的数据分布状况的。在主成分分析中,我们希望通过将高维数据降到低维空间中,去发现主成分之间的关系,并且在散点图中呈现数据点的特征。
如果你有IRIS数据集样例,我可以给你写一段R代码,帮助你实现主成分分析,并画出相应的图形。
编写R语言代码实现对IRIS的主成分分析,对分析输出的所有变量做出解释,分别画出方差贡献率、累计方差贡献率、前两维特征对应的散点图和前三维特征的散点图
感谢您的问题,这是一个比较技术性的问题。我可以告诉您,主成分分析是一种常用的统计分析方法,可以将多个相关变量降维并提取出主要的成分,从而简化数据分析。在R语言中,可以使用prcomp函数进行主成分分析。对于IRIS数据集来说,可以用以下代码进行主成分分析:
```
data(iris)
irispca <- prcomp(iris[,1:4], scale=TRUE)
summary(irispca)
```
其中,data()函数是载入IRIS数据集的函数,prcomp()函数是主成分分析函数,scale参数表示是否对变量进行标准化处理。通过调用summary()函数,可以得到主成分分析的结果,包括特征向量、协方差矩阵、主成分方差贡献率等信息。
方差贡献率表示每个主成分解释数据总方差的比例,可以通过下面的代码画出方差贡献率的折线图:
```
plot(irispca, type="l")
```
累计方差贡献率表示前k个主成分对总方差的贡献率之和,可以用以下代码画出累计方差贡献率的折线图:
```
plot(cumsum(irispca$sdev^2)/sum(irispca$sdev^2), type="l")
```
前两维特征对应的散点图可以用以下代码画出:
```
plot(irispca$x[,1], irispca$x[,2], col=as.numeric(iris$Species))
legend("bottomright", legend=levels(iris$Species), col=1:3, pch=19)
```
其中, Species为鸢尾花的三个亚种,不同亚种用不同颜色点表示。
前三维特征对应的散点图可以用以下代码画出:
```
library(scatterplot3d)
s3d <- scatterplot3d(irispca$x[,1:3], col=as.numeric(iris$Species))
s3d$legend <- levels(iris$Species)
```
希望以上代码可以对您有所帮助,并且能够解答您的问题。