avg_val_loss, mask_pred = valid_fn( valid_loader, model, criterion, device, valid_xyxys, valid_mask_gt)中的mask_pred是什么

时间: 2024-05-21 10:15:06 浏览: 18
在这个函数中,`mask_pred`是模型在验证集上对输入的预测掩码。具体来说,`valid_loader`是验证集的数据加载器,`model`是训练好的神经网络模型,`criterion`是用于计算损失的函数,`device`是指定计算设备,`valid_xyxys`是验证集中所有的图像框坐标,`valid_mask_gt`是验证集中所有的真实掩码。`mask_pred`是模型对每个图像框预测的掩码,其形状为`(batch_size, num_masks, height, width)`,其中`batch_size`是输入数据的批大小,`num_masks`是每个图像框中物体的数量,`height`和`width`分别是输入图像的高度和宽度。
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brier <- brier_efron(y_train_true = y_dat, y_train_pred = y_dat_pred, y_newdata = y_val, y_newdata_pred = y_val_pred, times = c(1:10)) brier$bs改成python

在Python中,你可以使用上面提供的`brier_efron`函数来计算Brier分数。以下是将R代码转换为Python代码的版本: ```python import pandas as pd import numpy as np from lifelines.utils import concordance_index def brier_efron(y_train_true, y_train_pred, y_newdata, y_newdata_pred, times): baseline = base_efron(y_train_true, y_train_pred) y_newdata = pd.DataFrame(y_newdata, columns=["time", "event"]) y_newdata = y_newdata.sort_values(by="time") y_newdata_pred = y_newdata_pred[y_newdata.index] Y_x = np.zeros((len(y_newdata), len(times))) for i, x in enumerate(times): Y_x[:, i] = np.where(y_newdata["time"] > x, 1, 0) kmf = KaplanMeierFitter().fit(y_newdata["time"], event_observed=y_newdata["event"]) G_t = kmf.survival_function_at_times(times).values.flatten() G_x = kmf.predict(y_newdata["time"]).values.flatten() W_x = np.zeros((len(y_newdata), len(times))) for t in range(len(times)): W_x[:, t] = (1 - Y_x[:, t]) * y_newdata["event"] / G_x + Y_x[:, t] / G_t[t] Lambda_t = [baseline.baseline_hazard_[baseline.baseline_survival_.index(baseline.baseline_survival_.index <= x)].sum() for x in times] S_x = np.exp(-np.exp(y_newdata_pred) @ np.array(Lambda_t)) BS_t = [np.mean(W_x[:, x] * (Y_x[:, x] - S_x[:, x])**2) for x in range(len(times))] return pd.DataFrame({"time": times, "bs": BS_t}) # 使用示例 y_dat = [...] # y_train_true的值 y_dat_pred = [...] # y_train_pred的值 y_val = [...] # y_newdata的值 y_val_pred = [...] # y_newdata_pred的值 times = np.arange(1, 11) brier_result = brier_efron(y_train_true=y_dat, y_train_pred=y_dat_pred, y_newdata=y_val, y_newdata_pred=y_val_pred, times=times) print(brier_result) ``` 请注意替换`[...]`部分的数据为实际的数据值。`brier_result`将是一个包含时间和Brier分数的数据框。你可以根据需要对结果进行进一步操作。

epoch-loss 和epoch_val_loss

epoch-loss 和 epoch_val_loss 是在深度学习中常用的指标,用于评估模型的训练和验证效果。 epoch-loss 是在模型训练过程中,每个 epoch 结束时计算的训练集上的损失,它反映了模型对训练数据的拟合程度。通常我们希望 epoch-loss 能够逐渐减小,表示模型不断优化。 epoch_val_loss 是在模型验证过程中,每个 epoch 结束时计算的验证集上的损失,它反映了模型对新数据的泛化能力。通常我们希望 epoch_val_loss 能够稳定或者逐渐减小,表示模型对新数据的预测效果比较好。 通过观察 epoch-loss 和 epoch_val_loss 的变化趋势,我们可以判断模型是否存在欠拟合或者过拟合,并对模型进行调整。

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详细分析一下python代码:import torch.optim as optim criterion = nn.CrossEntropyLoss() optimizer = optim.Adam(net.parameters(), lr=0.01, betas=(0.9, 0.999), eps=1e-08, weight_decay=0, amsgrad=False) scheduler = optim.lr_scheduler.ReduceLROnPlateau(optimizer, mode='min', factor=0.1, patience=10, verbose=True, min_lr=0) loss_hist, acc_hist = [], [] loss_hist_val, acc_hist_val = [], [] for epoch in range(140): running_loss = 0.0 correct = 0 for data in train_loader: batch, labels = data batch, labels = batch.to(device), labels.to(device) optimizer.zero_grad() outputs = net(batch) loss = criterion(outputs, labels) loss.backward() optimizer.step() # compute training statistics _, predicted = torch.max(outputs, 1) correct += (predicted == labels).sum().item() running_loss += loss.item() avg_loss = running_loss / len(train_set) avg_acc = correct / len(train_set) loss_hist.append(avg_loss) acc_hist.append(avg_acc) # validation statistics net.eval() with torch.no_grad(): loss_val = 0.0 correct_val = 0 for data in val_loader: batch, labels = data batch, labels = batch.to(device), labels.to(device) outputs = net(batch) loss = criterion(outputs, labels) _, predicted = torch.max(outputs, 1) correct_val += (predicted == labels).sum().item() loss_val += loss.item() avg_loss_val = loss_val / len(val_set) avg_acc_val = correct_val / len(val_set) loss_hist_val.append(avg_loss_val) acc_hist_val.append(avg_acc_val) net.train() scheduler.step(avg_loss_val) print('[epoch %d] loss: %.5f accuracy: %.4f val loss: %.5f val accuracy: %.4f' % (epoch + 1, avg_loss, avg_acc, avg_loss_val, avg_acc_val))

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