> library(data.table) > > # 设置工作目录 > setwd("/Users/imac/Desktop/summary_process") > > # 读取csv文件 > data <- fread("output_summary15.csv") > > # 选择需要的列 > cols <- c(V1, V2, V24, V15, V3.y, V7) Error: object 'V1' not found >

这个错误是因为`V1`等变量没有被定义。您需要将列名（或列索引）作为字符向量传递给`cols`变量。请尝试将`cols`定义为字符向量，像这样：

cols <- c("V1", "V2", "V24", "V15", "V3.y", "V7")

或者，您可以使用列索引而不是列名，像这样：

cols <- c(1, 2, 24, 15, 3, 7)

然后，您可以使用`data[, ..cols]`选择需要的列。

相关问题

> data <- fread("/Users/imac/Desktop/summary_process/output_summary15.csv") > library(data.table) > setwd("/Users/imac/Desktop/summary_process") > data <- fread("output_summary15.csv") > cols <- c(4, 5, 25, 17, 26, 10) > selected_data <- data[, cols] Error in `[.data.table`(data, , cols) : j (the 2nd argument inside [...]) is a single symbol but column name 'cols' is not found. Perhaps you intended DT[, ..cols]. This difference to data.frame is deliberate and explained in FAQ 1.1.

这个错误是因为在`data[, cols]`中，`cols`被解释为一个列名，而不是列的索引。可以使用`..cols`来解决这个问题，因为`..`告诉`data.table`使用变量的值而不是变量名。

以下是修改后的代码：

library(data.table)

# 设置工作目录
setwd("/Users/imac/Desktop/summary_process")

# 读取csv文件
data <- fread("output_summary15.csv")

# 选择需要的列
cols <- c(4, 5, 25, 17, 26, 10)
selected_data <- data[, ..cols]

# 将列粘在一起
text <- apply(selected_data, 1, function(x) {
  paste(x[1], x[2], "blastx", x[3], x[4], "blastn", x[5], x[6], sep = "::")
})

# 使用gsub函数将空格替换为.
text <- gsub(" ", ".", text)

# 将文本转化为数据框
new_data <- data.frame(text)

# 写入新文件
write.csv(new_data, "new_file.csv", row.names = FALSE)

请注意，我只是修改了第5和第8行的代码，以便正确选择列。

library(data.table) > > # 设置工作目录 > setwd("/Users/imac/Desktop/summary_process") > > # 读取csv文件 > data <- fread("output_summary15.csv") > > # 选择需要的列 > cols <- c("V1", "V2", "V24", "V15", "V3.y", "V7") > selected_data <- data[, ..cols] > > # 将列粘在一起 > text <- apply(selected_data, 1, function(x) { + paste(x["V1"], x["V2"], "blastx", x["V24"], x["V15"], "blastn", x["V3.y"], x["V7"], sep = "::")) Error: unexpected ')' in: "text <- apply(selected_data, 1, function(x) { paste(x["V1"], x["V2"], "blastx", x["V24"], x["V15"], "blastn", x["V3.y"], x["V7"], sep = "::"))" >

这个错误是因为在`paste()`函数中有多余的`)`。请将最后的`)`删除，像这样：

text <- apply(selected_data, 1, function(x) {
  paste(x["V1"], x["V2"], "blastx", x["V24"], x["V15"], "blastn", x["V3.y"], x["V7"], sep = "::")
})

这将确保函数调用正确，并将结果存储在`text`中。