在4.1.3版本的R语言中建立加权有向ergm模型,模型中的变量包含边和几何几何加权二元共享伙伴,参照分布项设置为泊松分布,借助MCMCpack包对模型分别使用MH采样函数以及Gibbs采样函数下的MCMC算法进行参数估计,迭代1000次,并且绘制后验密度图、迭代轨迹图、自相关图像

时间: 2024-02-05 19:11:45 浏览: 10
建立加权有向ergm模型的代码如下: ```{r} library(ergm) data <- read.csv("data.csv") model <- ergm(data ~ edges + gwesp(0.1, fixed = TRUE), response = "weight", control = control.ergm(seed = 123)) ``` 其中,`data`为数据集,`edges`为边的数量,`gwesp`为几何几何加权二元共享伙伴,`response`为响应变量为权重。我们使用控制参数`control.ergm`设置随机数种子为123。 使用MH采样函数进行MCMC算法: ```{r} library(MCMCpack) set.seed(123) mcmc.mh <- MCMCmetrop1R(model, burnin = 100, mcmc = 1000) ``` 其中,`burnin`为预烧期,`mcmc`为采样次数。 使用Gibbs采样函数进行MCMC算法: ```{r} set.seed(123) mcmc.gibbs <- MCMCgibbsR(model, burnin = 100, mcmc = 1000) ``` 绘制后验密度图: ```{r} library(coda) plot(density(as.mcmc(mcmc.mh))) plot(density(as.mcmc(mcmc.gibbs))) ``` 绘制迭代轨迹图: ```{r} plot(as.mcmc(mcmc.mh)) plot(as.mcmc(mcmc.gibbs)) ``` 绘制自相关图像: ```{r} acf(as.mcmc(mcmc.mh)) acf(as.mcmc(mcmc.gibbs)) ```

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