faster rcnn实现有丝分裂细胞检测python代码
时间: 2023-10-02 15:06:50 浏览: 152
以下是使用 Faster R-CNN 实现有丝分裂细胞检测的 Python 代码示例:
首先,需要安装必要的库。可以使用以下命令安装需要的库:
```
pip install tensorflow==1.15.0 keras==2.2.4 opencv-python==4.2.0.32 h5py==2.10.0 pandas==1.0.3 matplotlib==3.2.1
```
然后,下载预训练的 Faster R-CNN 模型和 COCO 数据集标签文件。可以使用以下命令下载:
```
wget https://github.com/OlafenwaMoses/ImageAI/releases/download/essentials-v5/resnet50_coco_best_v2.1.0.h5
wget https://raw.githubusercontent.com/OlafenwaMoses/ImageAI/master/imagenet_classes.json
```
最后,使用以下代码进行有丝分裂细胞检测:
```python
from imageai.Detection import ObjectDetection
import os
execution_path = os.getcwd()
# 创建 ObjectDetection 类的实例
detector = ObjectDetection()
# 设置模型路径和标签文件路径
detector.setModelTypeAsRetinaNet()
detector.setModelPath( os.path.join(execution_path , "resnet50_coco_best_v2.1.0.h5"))
detector.loadModel()
# 设置输入图像路径和输出图像路径
detections, extracted_images = detector.detectObjectsFromImage(input_image=os.path.join(execution_path , "input.jpg"), output_image_path=os.path.join(execution_path , "output.jpg"), minimum_percentage_probability=30)
# 打印检测结果
for eachObject in detections:
print(eachObject["name"] , " : " , eachObject["percentage_probability"], " : ", eachObject["box_points"] )
print("--------------------------------")
```
在上述代码中,`input.jpg` 是输入图像的路径,`output.jpg` 是输出图像的路径。`minimum_percentage_probability` 参数用于控制检测的置信度阈值。检测结果将打印在控制台上。
需要注意的是,由于 Faster R-CNN 模型在 COCO 数据集上进行了训练,所以可能无法直接应用于有丝分裂细胞检测。你可能需要在 COCO 数据集上进行微调,或者使用其他针对有丝分裂细胞检测的数据集进行训练。
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