cat GFP_orig.fa | sed s/L29345\.\1\ Aequorea\ victoria\ green\-fluorescent\ protein\ \(GFP\)\ mRNA\,\ complete\ cds/GFP/ > GFP.fa
时间: 2024-04-28 09:18:24 浏览: 12
这个命令的作用是将GFP_orig.fa文件中的"L29345.\1 Aequorea victoria green-fluorescent protein (GFP) mRNA, complete cds"替换为"GFP",并将结果保存在GFP.fa文件中。其中,"cat GFP_orig.fa"表示读取GFP_orig.fa文件的内容;"sed s/L29345.\1\ Aequorea\ victoria\ green\-fluorescent\ protein\ \(GFP\)\ mRNA\,\ complete\ cds/GFP/"表示将指定的字符串替换为"GFP","\1"表示正则表达式中的引用捕获组,用于匹配特定的字符;"> GFP.fa"表示将结果输出到GFP.fa文件中。
需要注意的是,这个命令中的正则表达式可能需要根据实际情况进行调整。
相关问题
V4L2DecoderThre invoked oom-killer: gfp_mask=0x2dc0(GFP_KERNEL|__GFP_NOWARN|__GFP_ZERO), order=3, oom_score_adj=-1000
这段信息看起来是一个内核级别的错误日志。其中oom-killer是Linux内核中用于处理内存不足的进程的守护进程。当系统中的可用内存不足时,oom-killer会选择一个进程并将其杀死,以释放内存。在这里,V4L2DecoderThre进程被oom-killer杀死了,原因是系统中的可用内存不足,所以内核选择了它。
这种错误通常是由于系统资源不足所致,例如内存或交换空间。您可以尝试增加系统资源,例如增加内存或交换空间,以避免这种错误的发生。
uap->dmatx.buf = kmalloc(PL011_DMA_BUFFER_SIZE, GFP_KERNEL | __GFP_DMA);是什么意思
这段代码是在 Linux 内核中使用 kmalloc 函数为 uap->dmatx.buf 分配内存空间。kmalloc 是一种分配内核内存的函数,它接受两个参数:分配的大小和分配内存时的标志。在这里,分配的大小是 PL011_DMA_BUFFER_SIZE,标志使用了 GFP_KERNEL | __GFP_DMA。GFP_KERNEL 表示在内核上下文中进行内存分配,__GFP_DMA 表示分配的内存需要位于可进行 DMA 操作的区域。
因此,这段代码的作用是为 uap->dmatx.buf 分配大小为 PL011_DMA_BUFFER_SIZE 的内核内存,并且这段内存可以用于 DMA 操作。