cat GFP_orig.fa | sed s/L29345\.\1\ Aequorea\ victoria\ green\-fluorescent\ protein\ \(GFP\)\ mRNA\,\ complete\ cds/GFP/ > GFP.fa
时间: 2024-04-28 15:18:24 浏览: 141
G.7041中文版,关于GFP协议
这个命令的作用是将GFP_orig.fa文件中的"L29345.\1 Aequorea victoria green-fluorescent protein (GFP) mRNA, complete cds"替换为"GFP",并将结果保存在GFP.fa文件中。其中,"cat GFP_orig.fa"表示读取GFP_orig.fa文件的内容;"sed s/L29345.\1\ Aequorea\ victoria\ green\-fluorescent\ protein\ \(GFP\)\ mRNA\,\ complete\ cds/GFP/"表示将指定的字符串替换为"GFP","\1"表示正则表达式中的引用捕获组,用于匹配特定的字符;"> GFP.fa"表示将结果输出到GFP.fa文件中。
需要注意的是,这个命令中的正则表达式可能需要根据实际情况进行调整。
阅读全文