生物数据库介绍——NCBI
时间: 2023-10-22 13:07:20 浏览: 1843
NCBI(National Center for Biotechnology Information)是美国国家生物技术信息中心,是重要的生物数据库和生物信息资源提供者。它提供了丰富的生物学、医学和生物技术相关数据和工具,为科学家、研究人员和医学专业人士提供了广泛的信息和支持。
NCBI拥有多个重要的数据库,其中包括:
1. GenBank:这是一个全球最大的DNA序列数据库,包含了来自各种生物物种的数十亿条核酸序列数据。
2. PubMed:这是一个生命科学和医学领域的文献数据库,收录了来自全球各地的科学文章摘要和全文。
3. BLAST:这是一个广泛使用的序列比对工具,可以用于分析DNA、RNA和蛋白质序列的相似性。
4. PubChem:这是一个化学物质数据库,包含了数百万种化合物的化学结构、属性和相关信息。
此外,NCBI还提供了许多其他数据库和工具,如Gene、Protein、Taxonomy等,用于基因组学、蛋白质学、系统发育学等领域的研究。
研究人员可以通过NCBI的网站访问这些数据库,并使用各种搜索和分析工具来获取所需的生物信息。这些数据和工具对于遗传学、生物医学研究、药物开发等领域都具有重要的支持作用。
相关问题
ensembl数据库
Ensembl数据库是一项生物信息学研究计划,旨在开发一种能够对真核生物基因组进行自动注释并维护的软件。它的基因数据集是根据mRNA和蛋白质序列的数据信息进行注释的,并且数据来源包括新的基因组数据、UniProt/SwissProt和UniProt/TrEMBL的蛋白质序列、NCBI的RefSeq中的DNA和蛋白质序列以及EMBL的cDNA序列。Ensembl是一个开源的基因注释软件系统,很多网站都采用Ensembl这套软件系统,并且它还拥有特有的BioMart功能,可以根据设定的条件对基因组进行检索并以图表形式呈现结果。此外,Ensembl还能与其他数据库整合,进行基因组间的比较分析。Ensembl数据库中储存了各种来源的突变数据,包括SNP、CNV、等位基因频率和基因型等,这些数据经过质量控制后被导入到数据库中。Ensembl是几个知名的基因组浏览器之一,用于检索基因组学信息,与NCBI Map Viewer和UCSC基因组浏览器相比,Ensembl的注释方式、数据来源和功能略有不同。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span>
#### 引用[.reference_title]
- *1* *3* [Ensembl数据库简介](https://blog.csdn.net/dingsheng56656/article/details/101889585)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v92^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"]
- *2* [Ensembl突变数据描述之(一)——突变物种数据库及预测工具](https://blog.csdn.net/weixin_30367543/article/details/99205142)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v92^chatsearchT3_1"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"]
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