生物数据库介绍——NCBI
时间: 2023-10-22 20:07:20 浏览: 673
NCBI(National Center for Biotechnology Information)是美国国家生物技术信息中心,是重要的生物数据库和生物信息资源提供者。它提供了丰富的生物学、医学和生物技术相关数据和工具,为科学家、研究人员和医学专业人士提供了广泛的信息和支持。
NCBI拥有多个重要的数据库,其中包括:
1. GenBank:这是一个全球最大的DNA序列数据库,包含了来自各种生物物种的数十亿条核酸序列数据。
2. PubMed:这是一个生命科学和医学领域的文献数据库,收录了来自全球各地的科学文章摘要和全文。
3. BLAST:这是一个广泛使用的序列比对工具,可以用于分析DNA、RNA和蛋白质序列的相似性。
4. PubChem:这是一个化学物质数据库,包含了数百万种化合物的化学结构、属性和相关信息。
此外,NCBI还提供了许多其他数据库和工具,如Gene、Protein、Taxonomy等,用于基因组学、蛋白质学、系统发育学等领域的研究。
研究人员可以通过NCBI的网站访问这些数据库,并使用各种搜索和分析工具来获取所需的生物信息。这些数据和工具对于遗传学、生物医学研究、药物开发等领域都具有重要的支持作用。
相关问题
ncbi的sar数据库如何使用
NCBI的SAR数据库是一种用于存储和查询一系列SAR(structure-activity relationship)数据的数据库。它提供了关于化合物结构与活性之间关系的信息,对于药物设计和发现等领域的研究非常有用。
要使用NCBI的SAR数据库,可以按照以下步骤操作:
1. 打开NCBI的官方网站(www.ncbi.nlm.nih.gov)。
2. 在网站的搜索栏中输入"SAR"。
3. 在搜索结果中选择"SAR database",或者直接访问链接(https://sarco.cancer.gov/)。
4. 在SAR数据库的主页上,可以使用搜索栏来查找感兴趣的化合物或者活性数据。可以根据化合物名称、SMILES字符串、CAS号或其他相关信息进行搜索。
5. 在搜索结果页面中,可以查看与所查询化合物相关的结构与活性数据,例如活性评价数据、ADMET(absorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity)属性等。
6. 可以进一步筛选搜索结果,根据不同的关键词进行过滤,以获得更精确的结果。
7. 在查看特定化合物的详细信息时,可以获取化合物的结构式、物理化学性质、活性评价数据以及相关的文献引用等。
8. SAR数据库还提供交互式工具用于可视化和分析化合物结构与活性数据,包括制定相关的定量结构活性关系(QSAR)模型。
总之,使用NCBI的SAR数据库可以通过搜索和查询相关的化合物结构与活性数据,为药物研究和发现提供重要的支持和参考。希望以上回答能够帮助您理解并使用该数据库。
NCBI的SRA数据库是什么
NCBI的SRA(Sequence Read Archive)数据库是一个用于存储高通量测序(next-generation sequencing, NGS)数据的公共数据库。该数据库包含来自各种生物体的DNA和RNA测序数据,包括基因组测序、转录组测序、外显子组测序、甲基化测序等。SRA数据库为全球科学家提供了一个重要的资源,使得他们可以在研究中使用这些数据,从而加速生命科学的发展。