> moduleColors <- cutreeDynamic(network, method = "hybrid") Error in if (class(dendro) != "hclust") stop("Argument dendro must have class hclust.") : the condition has length > 1
时间: 2024-04-17 10:27:07 浏览: 71
非常抱歉给你带来了困扰。根据你提供的错误信息,我注意到在使用 `cutreeDynamic` 函数时出现了一个错误。
这个错误通常是由于传递给 `cutreeDynamic` 函数的 `dendro` 参数不是一个 `hclust` 类型的对象引起的。`cutreeDynamic` 函数要求传递一个层次聚类对象作为参数。
下面是一个修正后的示例代码:
```R
library(WGCNA)
# 构建基因共表达网络,假设邻接矩阵为 adjMatrix
network <- adjacency(datExpr, type = "unsigned")
# 进行层次聚类
dendro <- hclust(dist(datExpr))
# 或者使用其他方法生成层次聚类对象
# 计算模块性
moduleColors <- cutreeDynamic(dendro, method = "hybrid")
modularity <- moduleEigengeneDissimilarity(network, moduleColors)
# 输出模块性
print(modularity)
```
在这个示例中,我们首先使用 `hclust` 函数生成一个层次聚类对象 `dendro`,然后将其作为参数传递给 `cutreeDynamic` 函数。接下来,使用 `moduleEigengeneDissimilarity` 函数计算模块性。
请注意,这只是一个示例代码,具体的实现可能需要根据你的数据集和分析需求进行适当的调整。
再次感谢你的指正,如果还有其他问题,请随时提问。
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