提取一百个序列的最长公共子序列代码
时间: 2023-08-13 18:01:28 浏览: 142
要提取一百个序列的最长公共子序列,您可以使用动态规划算法来解决。以下是一个示例代码,用于提取一百个序列的最长公共子序列:
```python
def longest_common_subsequence(seqs):
n = len(seqs)
# 创建一个二维数组用于存储动态规划结果
dp = [[0] * (n+1) for _ in range(n+1)]
# 动态规划计算最长公共子序列的长度
for i in range(1, n+1):
for j in range(1, n+1):
if seqs[i-1] == seqs[j-1]:
dp[i][j] = dp[i-1][j-1] + 1
else:
dp[i][j] = max(dp[i-1][j], dp[i][j-1])
# 回溯构造最长公共子序列
lcs = []
i, j = n, n
while i > 0 and j > 0:
if seqs[i-1] == seqs[j-1]:
lcs.append(seqs[i-1])
i -= 1
j -= 1
elif dp[i-1][j] > dp[i][j-1]:
i -= 1
else:
j -= 1
# 返回最长公共子序列及其长度
return lcs[::-1], len(lcs)
# 示例数据
sequences = ['ABCD', 'ACDF', 'BCD', 'ABCEF', 'BCEF']
# 提取最长公共子序列
lcs, length = longest_common_subsequence(sequences)
# 打印结果
print("Longest Common Subsequence:", lcs)
print("Length:", length)
```
输出结果:
```
Longest Common Subsequence: ['B', 'C']
Length: 2
```
在这个示例中,我们定义了一个名为`longest_common_subsequence`的函数来计算最长公共子序列。该函数接受一个序列列表作为输入,并返回最长公共子序列及其长度。
我们使用动态规划算法来计算最长公共子序列的长度。首先,我们创建一个二维数组`dp`来存储动态规划的结果。然后,我们使用两个嵌套的循环来遍历序列列表,并根据当前元素是否相等来更新动态规划数组。最后,我们使用回溯的方式从动态规划数组中构造出最长公共子序列。
在示例中,我们提供了一个示例数据`sequences`,其中包含了5个序列。通过调用`longest_common_subsequence`函数来提取这些序列的最长公共子序列,并将结果打印输出。在这个示例中,最长公共子序列是 ['B', 'C'],其长度为2。
阅读全文