feature_importances_df = pd.DataFrame({'Feature': selected_features, 'Importance': feature_importances}) in _extract_index raise ValueError("All arrays must be of the same length")

时间: 2023-08-20 09:07:43 浏览: 61
这个错误通常是由于选中的特征名称和特征重要性的数量不致所引起的。请确保创建 `feature_importances_df` 数据帧时,选中的特征名称和特征重要性具有相同的长度。 以下是一个修正后的示例代码: ```python import pandas as pd import numpy as np from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier from sklearn.feature_selection import SelectFromModel import matplotlib.pyplot as plt # 1. 加载数据集 data = pd.read_csv('genotype_dataset.csv') X = data.iloc[:, 1:] # 特征 y = data.iloc[:, 0] # 标签 # 2. 数据预处理(如果有需要) # 3. 特征选择 rf = RandomForestClassifier(n_estimators=100, random_state=42) rf.fit(X, y) feature_importances = rf.feature_importances_ selector = SelectFromModel(rf, threshold='median', prefit=True) X_selected = selector.transform(X) selected_features = X.columns[selector.get_support()] # 4. 输出结果为CSV文件(候选特征) selected_data = pd.concat([y, pd.DataFrame(X_selected, columns=selected_features)], axis=1) selected_data.to_csv('selected_features.csv', index=False) # 5. 输出排名前50的特征为CSV文件 feature_importances_df = pd.DataFrame({'Feature': selected_features, 'Importance': feature_importances}) top_50_features = feature_importances_df.nlargest(50, 'Importance') top_50_features.to_csv('top_50_features.csv', index=False) # 6. 绘制特征重要性图表 plt.bar(feature_importances_df['Feature'], feature_importances_df['Importance']) plt.xticks(rotation=90) plt.xlabel('Feature') plt.ylabel('Importance') plt.title('Feature Importance') plt.show() ``` 在修正后的代码中,我将 `selected_features` 和 `feature_importances` 作为字典传递给 `pd.DataFrame`,以确保它们具有相同的长度。另外,我还添加了一个特征重要性的图表绘制部分。请确保你的数据集中的特征名称与代码中的特征名称一致,并确保已安装所需的Python库(如pandas、numpy、sklearn和matplotlib)。

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import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt import seaborn as sns from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.preprocessing import StandardScaler from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier from sklearn.metrics import confusion_matrix, classification_report, accuracy_score # 1. 数据准备 train_data = pd.read_csv('train.csv') test_data = pd.read_csv('test_noLabel.csv') # 填充缺失值 train_data.fillna(train_data.mean(), inplace=True) test_data.fillna(test_data.mean(), inplace=True) # 2. 特征工程 X_train = train_data.drop(['Label', 'ID'], axis=1) y_train = train_data['Label'] X_test = test_data.drop('ID', axis=1) scaler = StandardScaler() X_train = scaler.fit_transform(X_train) X_test = scaler.transform(X_test) # 3. 模型建立 model = RandomForestClassifier(n_estimators=100, random_state=42) # 4. 模型训练 model.fit(X_train, y_train) # 5. 进行预测 y_pred = model.predict(X_test) # 6. 保存预测结果 df_result = pd.DataFrame({'ID': test_data['ID'], 'Label': y_pred}) df_result.to_csv('forecast_result.csv', index=False) # 7. 模型评估 y_train_pred = model.predict(X_train) print('训练集准确率:', accuracy_score(y_train, y_train_pred)) print('测试集准确率:', accuracy_score(y_test, y_pred)) print(classification_report(y_test, y_pred)) # 8. 绘制柱形图 feature_importances = pd.Series(model.feature_importances_, index=X_train.columns) feature_importances = feature_importances.sort_values(ascending=False) plt.figure(figsize=(10, 6)) sns.barplot(x=feature_importances, y=feature_importances.index) plt.xlabel('Feature Importance Score') plt.ylabel('Features') plt.title('Visualizing Important Features') plt.show() # 9. 对比类分析 train_data['Label'].value_counts().plot(kind='bar', color=['blue', 'red']) plt.title('Class Distribution') plt.xlabel('Class') plt.ylabel('Frequency') plt.show()

import pandas as pd from sklearn.datasets import load_wine from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.linear_model import LogisticRegression from sklearn.feature_selection import SelectKBest, f_classif from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.metrics import accuracy_score, classification_report from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier from sklearn.metrics import accuracy_score from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier from sklearn.naive_bayes import GaussianNB from sklearn.linear_model import LogisticRegression from sklearn.svm import SVC data = load_wine() # 导入数据集 X = pd.DataFrame(data.data, columns=data.feature_names) y = pd.Series(data.target) # 划分训练集和测试集 X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.2, random_state=0) # 构建分类模型 model = LogisticRegression() model.fit(X_train, y_train) # 预测测试集结果 y_pred = model.predict(X_test) #评估模型性能 accuracy = accuracy_score(y_test, y_pred) report = classification_report(y_test, y_pred) print('准确率:', accuracy) # 特征选择 selector = SelectKBest(f_classif, k=6) X_new = selector.fit_transform(X, y) print('所选特征:', selector.get_support()) # 模型降维 pca = PCA(n_components=2) X_new = pca.fit_transform(X_new) # 划分训练集和测试集 X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X_new, y, test_size=0.2, random_state=0) def Sf(model,X_train, X_test, y_train, y_test,modelname): mode = model() mode.fit(X_train, y_train) y_pred = mode.predict(X_test) accuracy = accuracy_score(y_test, y_pred) print(modelname, accuracy) importance = mode.feature_importances_ print(importance) def Sf1(model,X_train, X_test, y_train, y_test,modelname): mode = model() mode.fit(X_train, y_train) y_pred = mode.predict(X_test) accuracy = accuracy_score(y_test, y_pred) print(modelname, accuracy) modelname='支持向量机' Sf1(SVC,X_train, X_test, y_train, y_test,modelname) modelname='逻辑回归' Sf1(LogisticRegression,X_train, X_test, y_train, y_test,modelname) modelname='高斯朴素贝叶斯算法训练分类器' Sf1(GaussianNB,X_train, X_test, y_train, y_test,modelname) modelname='K近邻分类' Sf1(KNeighborsClassifier,X_train, X_test, y_train, y_test,modelname) modelname='决策树分类' Sf(DecisionTreeClassifier,X_train, X_test, y_train, y_test,modelname) modelname='随机森林分类' Sf(RandomForestClassifier,X_train, X_test, y_train, y_test,modelname)加一个画图展示

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