python库读取cif文件_Pymatgen读/写各种文件,pymatgen,读写
时间: 2024-03-07 20:04:08 浏览: 415
cif文件是晶体结构文件的一种,Pymatgen是一个Python库,提供了读取和写入多种晶体结构文件的功能,包括cif文件。
以下是使用Pymatgen读取cif文件的示例代码:
```python
from pymatgen import Structure
# 读取cif文件
structure = Structure.from_file('example.cif')
# 输出晶格参数
print('晶格参数:', structure.lattice)
# 输出原子坐标
for site in structure:
print(site)
```
以下是使用Pymatgen写入cif文件的示例代码:
```python
from pymatgen import Structure
# 创建晶体结构
structure = Structure.from_spacegroup('Fm-3m', ((0, 0, 0),), ['Ni'], [[0, 0, 0]])
# 写入cif文件
structure.to(filename='example.cif')
```
需要注意的是,使用Pymatgen读取cif文件时,需要保证cif文件的格式正确,否则会出现读取错误。同时,Pymatgen还支持读取和写入多种其他的晶体结构文件,具体可参考其官方文档。
阅读全文